More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5472 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 306 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8494  dihydrodipicolinate synthase  65.89 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2368  dihydrodipicolinate synthetase  65.77 
 
 		 301 aa  411  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4876  dihydrodipicolinate synthetase  56.8 
 
 		 296 aa  328  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.389418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4686  dihydrodipicolinate synthetase  40.57 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  36.93 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.1 
 
 		 308 aa  172  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  34.86 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  34.53 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  35.46 
 
 		 314 aa  168  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.11 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  35.77 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  37.13 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  32.27 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  35.15 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.67 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 290 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  31.97 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  31.71 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  35.61 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  31.53 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 289 aa  159  8e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  35.77 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  35.82 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  35 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  34.36 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  35.38 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  36.98 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  35.12 
 
 		 300 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  34.2 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  34.11 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  31.29 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00126  dihydrodipicolinate synthase  35 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  33.11 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  34.05 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  34.05 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  34.05 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  34.67 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 296 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  32.42 
 
 		 308 aa  148  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  32.21 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  32.63 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  38.21 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  32 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  32.49 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  31.48 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  34.2 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  31.93 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  34.2 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  31.14 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>