More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4686 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4686  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  40.57 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2368  dihydrodipicolinate synthetase  42.41 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8494  dihydrodipicolinate synthase  40.99 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4876  dihydrodipicolinate synthetase  34.38 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.389418 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.34 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  35.59 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  32.69 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0999  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  29.63 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  32 
 
 		 300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  32.31 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  31.12 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  32.43 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  33.1 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  32.95 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  32.95 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  32.05 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  31.66 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  31.66 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  31.66 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  31.66 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  27.49 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  31.27 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  32.32 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  29.28 
 
 		 291 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  31.66 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  32.43 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  32.68 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.78 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  31.32 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  29.28 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  30.89 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  30.89 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  29.5 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  33.98 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  32.05 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.24 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  30.53 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 		 296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  31.37 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  31.52 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  32.44 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  30.99 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  30.89 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>