More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2368 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2368  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 301 aa  596  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  65.77 
 
 		 306 aa  411  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8494  dihydrodipicolinate synthase  69.55 
 
 		 313 aa  411  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4876  dihydrodipicolinate synthetase  58.64 
 
 		 296 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.389418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4686  dihydrodipicolinate synthetase  42.41 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  32.16 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  36.14 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  36.63 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.1 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  34.55 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  31.45 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  35.46 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.69 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  32.72 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 		 309 aa  158  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 293 aa  158  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  35.53 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  32.39 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  32.6 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 290 aa  155  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  32.39 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.63 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  31.3 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  32.96 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  32.84 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  32.3 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  31.11 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  31.87 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  34.6 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  34.56 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  30.26 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  31.32 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  32.63 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  32.95 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  32.57 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  31.15 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  32.26 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 294 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  32.29 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  32.47 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  31.47 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  30.97 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  32.29 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  32.29 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  30.55 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  32.26 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  33.46 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  32.26 
 
 		 296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  32.61 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  28.84 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>