More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2117 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2117  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 290 aa  570  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277384  normal  0.880374 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0556  dihydrodipicolinate synthetase  47.78 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1287  dihydrodipicolinate synthetase  44.97 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  32.19 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  38.81 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  35.97 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  36.75 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  35.25 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  36.88 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  35.21 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  37.29 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  33.69 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  34.91 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  43.46 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  35.05 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  33.93 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  36.8 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  36.8 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 294 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  35.47 
 
 		 308 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 294 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  35.07 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  31.67 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  31.18 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  35.09 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  34.28 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  30.39 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  34.41 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  35.97 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 		 296 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 		 296 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 290 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 290 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  34.05 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  31.65 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2201  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  34.98 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  35.79 
 
 		 332 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1735  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00310784  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  29.52 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  32.61 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  32.27 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.76 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  32.5 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  37.37 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  34.16 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  32.48 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  33.94 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  37.68 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  33.94 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  33.94 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  33.94 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  33.94 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  33.94 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>