More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6099 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
303 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  49.83 
 
 
309 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  45.36 
 
 
305 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  47.88 
 
 
316 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  45.7 
 
 
305 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  43.87 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  44.33 
 
 
320 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  44.33 
 
 
305 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08330  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  45.54 
 
 
317 aa  217  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.366488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  42.72 
 
 
328 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3391  dihydrodipicolinate synthetase  42.9 
 
 
309 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06720  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  39.53 
 
 
315 aa  200  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.159669  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  38.56 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0929  dihydrodipicolinate synthetase  37.62 
 
 
307 aa  190  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.568933 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  34.33 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  31.67 
 
 
291 aa  146  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  36.89 
 
 
291 aa  145  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  35.1 
 
 
306 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 
291 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 
296 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  34 
 
 
319 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 
294 aa  142  8e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  31.07 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.79 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  31.68 
 
 
296 aa  139  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.25 
 
 
301 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 
291 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  30.13 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  31.8 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  35.34 
 
 
309 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  33.44 
 
 
294 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  32.79 
 
 
313 aa  133  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  31.02 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  33.75 
 
 
292 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 
297 aa  132  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  29.57 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  25.75 
 
 
289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  34.41 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  29.8 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  30.43 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 
290 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  32.66 
 
 
295 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 
293 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  33.19 
 
 
292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  34.33 
 
 
287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  29.43 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  29.55 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  29.55 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  29.55 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  29.55 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  29.55 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  29.67 
 
 
290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  29.55 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  29.55 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  29.55 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 
290 aa  129  6e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.63 
 
 
308 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  31.51 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 
300 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 
300 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  34.59 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 
301 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  34.16 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  27.48 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  29.21 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  28.71 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  33.44 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  28.48 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  33.44 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  31 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  31.1 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  33.47 
 
 
302 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  32.45 
 
 
298 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  32.05 
 
 
292 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  33.06 
 
 
308 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  32.23 
 
 
293 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 
300 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  32.12 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  29.8 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  28.71 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 
301 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  29.97 
 
 
297 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 
297 aa  126  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 
298 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 
293 aa  125  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  29.7 
 
 
300 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>