More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3391 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3391  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
309 aa  620  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  87.38 
 
 
309 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  50.16 
 
 
309 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08330  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  50.16 
 
 
317 aa  277  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.366488  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  49.19 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  48.86 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  49.19 
 
 
320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  47.56 
 
 
305 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  47.4 
 
 
328 aa  267  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0929  dihydrodipicolinate synthetase  46.47 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.568933 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06720  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  45.95 
 
 
315 aa  257  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.159669  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  45.45 
 
 
330 aa  251  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  46.01 
 
 
316 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  42.9 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  30.32 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  30.32 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  30.32 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  26.95 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  30 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  32.56 
 
 
294 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  32 
 
 
294 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  27.24 
 
 
293 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 
298 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0522  dihydrodipicolinate synthetase  29.43 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000192059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 
301 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  28.25 
 
 
297 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 
326 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  31.45 
 
 
298 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  31.45 
 
 
298 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  30.39 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  31.02 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  28.06 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3581  dihydrodipicolinate synthetase  31.01 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  30.39 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  30.39 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  26.56 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  31.45 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 
295 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  28.2 
 
 
291 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  28.48 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 
301 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.67 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  29.02 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  24.67 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  26.56 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  26.56 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  29.26 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  27.33 
 
 
300 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 
292 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 
292 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 
292 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 
292 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  29.04 
 
 
292 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 
292 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 
295 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 
292 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 
301 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  29.03 
 
 
296 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 
296 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  31.07 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2063  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 
303 aa  109  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 
294 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  29.03 
 
 
296 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  28.06 
 
 
289 aa  108  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
291 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 
320 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  27.04 
 
 
294 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  28.96 
 
 
296 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  28.01 
 
 
294 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3470  dihydrodipicolinate synthase  27.11 
 
 
293 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604806  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 
313 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  24.83 
 
 
292 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.8 
 
 
301 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.32 
 
 
313 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  25.84 
 
 
292 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 
291 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 
332 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 
307 aa  106  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 
292 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 
298 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  26.71 
 
 
294 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>