More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3581 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3581  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 286 aa  588  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 303 aa  128  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  30.43 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  28.34 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  29.84 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  29.32 
 
 		 294 aa  118  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  28.83 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  28.52 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  31 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  31.73 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  30.7 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  27.71 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1540  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  30.64 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  28.08 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  29.72 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  29.92 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  29.2 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  27.31 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  28.77 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  29.62 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  29.92 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  32.14 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06720  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  32.24 
 
 		 315 aa  112  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.159669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  26.54 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  28.26 
 
 		 320 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  29.25 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  29.25 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  29.38 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  28.91 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  29.84 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  28.7 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  29.53 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  31.9 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  29.57 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  28.7 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  28.7 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  28.7 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  28.7 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  24.64 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  28.7 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  28.7 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  28.7 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  29.05 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  29.05 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  29.05 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  29.05 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  29.05 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  29.33 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  26.45 
 
 		 299 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 296 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  28.74 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  27.73 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  29.71 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  29.75 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  32.04 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  27.69 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  28.85 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.3 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  29.83 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  28.06 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  29.75 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  29.71 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  27.76 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  28.46 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00126  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>