More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2475 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  100 
 
 		 309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08330  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  54.02 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.366488  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  50.8 
 
 		 309 aa  287  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06720  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  50.49 
 
 		 315 aa  281  7.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.159669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0929  dihydrodipicolinate synthetase  49.52 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.568933 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  49.83 
 
 		 305 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  49.83 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  49.83 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  50.17 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3391  dihydrodipicolinate synthetase  50.16 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  47.37 
 
 		 330 aa  265  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  49.83 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  49.83 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  48.52 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  30.82 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  30.82 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  30.82 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.12 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  32.45 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  30.49 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  34.67 
 
 		 291 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  30.97 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  31.54 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  32.39 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  33.67 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  34.58 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  34.58 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  32.57 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  30.97 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0522  dihydrodipicolinate synthetase  29.18 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000192059 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  31.09 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  29.92 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  29.84 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  33.67 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  34.58 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  31.1 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.08 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  30.59 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  32.79 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  32.61 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  29.22 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  31.31 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  32.39 
 
 		 294 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  29.19 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  30.79 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  30.59 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  30.59 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  30.59 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  30.59 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3581  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  30.59 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  30.59 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  28.95 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  30.59 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  33.88 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  30.49 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  29.57 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  31.77 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  29.28 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  33.66 
 
 		 305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  33.47 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  29.75 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  31.67 
 
 		 291 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  26.49 
 
 		 291 aa  116  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  28.85 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  28.85 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3407  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 371 aa  115  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  30.86 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  30.86 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.79 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  26.82 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>