More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2150 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
330 aa  675    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06720  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  71.57 
 
 
315 aa  464  1e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.159669  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0929  dihydrodipicolinate synthetase  58.36 
 
 
307 aa  362  3e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.568933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08330  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  54.28 
 
 
317 aa  323  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.366488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  48.85 
 
 
328 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  47.73 
 
 
309 aa  269  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  47.37 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  45.13 
 
 
305 aa  263  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  45.13 
 
 
320 aa  263  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  41.18 
 
 
305 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  41.64 
 
 
305 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3391  dihydrodipicolinate synthetase  45.45 
 
 
309 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  43.23 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  38.56 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  31.39 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  29.89 
 
 
298 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  27.95 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  27.95 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.61 
 
 
298 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  30.17 
 
 
301 aa  122  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  31.43 
 
 
303 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  28.24 
 
 
298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  29.03 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 
307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  27.27 
 
 
294 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  27.39 
 
 
298 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  26.45 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  26.45 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  28.85 
 
 
305 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 
298 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 
298 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 
298 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  32.1 
 
 
291 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.18 
 
 
313 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  26.56 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  26.56 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  26.56 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  27.39 
 
 
298 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  26.89 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  27.95 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  26.47 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  26.69 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  29.64 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  29.7 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  26.23 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  27.48 
 
 
292 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31640  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  30.67 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  27.81 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 
303 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  26.58 
 
 
298 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  25.83 
 
 
294 aa  109  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  32.11 
 
 
291 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  27.39 
 
 
300 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  28.19 
 
 
304 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
301 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  30.71 
 
 
302 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  29.73 
 
 
295 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  25.33 
 
 
288 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  28.93 
 
 
302 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  27.06 
 
 
294 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  26.58 
 
 
290 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  27.89 
 
 
313 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 
291 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  32.24 
 
 
294 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  25.77 
 
 
297 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
300 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  29.39 
 
 
295 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  26.53 
 
 
294 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  31.4 
 
 
294 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
300 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  29.37 
 
 
306 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
300 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  26.89 
 
 
301 aa  106  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  26.4 
 
 
293 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  26.89 
 
 
296 aa  106  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  26.54 
 
 
296 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  28.46 
 
 
332 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  28.28 
 
 
309 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2144  dihydrodipicolinate synthase  30.12 
 
 
327 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00221445  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
301 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  25.99 
 
 
290 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 
320 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  29.8 
 
 
294 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  25.62 
 
 
292 aa  105  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  31.03 
 
 
302 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  26.38 
 
 
306 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  26.97 
 
 
294 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>