More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31640 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31640  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 292 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  33.69 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  34.48 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  31 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  30.97 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  34.78 
 
 		 294 aa  138  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  29.89 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  26.99 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.03 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  26.3 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  32.5 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.78 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  26.3 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  35.35 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  25.95 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.1 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  25.95 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  35.02 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  25.95 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  33.58 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  25.61 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  25.61 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  25.61 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  28.67 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  34.58 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  30.67 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  28.62 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  30.74 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  32.19 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  32.76 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  31.8 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  31.8 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  32.3 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  32.19 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  32.14 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.88 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  29.08 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  31.45 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  29.88 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.88 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  29.88 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  29.08 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  29.08 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.88 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  29.08 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.88 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  31.52 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  30.43 
 
 		 294 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  29.88 
 
 		 390 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  31.52 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.54 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.19 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  29.08 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  32.5 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  27.89 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  34.38 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 326 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  29.56 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 291 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00126  dihydrodipicolinate synthase  34.67 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  29.71 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  28.89 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  29.96 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  28.89 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  31.45 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  29.23 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  28.97 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  27.3 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  27.49 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  29.52 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  32.19 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  31.98 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  26.39 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  26.96 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  28.17 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  28.68 
 
 		 290 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  26.46 
 
 		 289 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 291 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  32.02 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>