More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0522 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0522  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 312 aa  644    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000192059 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  33.07 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  33.2 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  29.53 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  32.79 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  32.79 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  29.18 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  29.19 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  30.64 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  31.47 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  31.1 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  31.09 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  31.09 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  31.09 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3391  dihydrodipicolinate synthetase  29.43 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  28.67 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  27.24 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  27.53 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  30.1 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  28.21 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  28.63 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  28.63 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  28.63 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  30.83 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1735  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00310784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  28.47 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  29.46 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1160  dihydrodipicolinate synthetase  30.13 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  28.21 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  28.47 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  28.47 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  28.47 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  28.47 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3581  dihydrodipicolinate synthetase  26.94 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  26.6 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  26.44 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  27.67 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  27.97 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1287  dihydrodipicolinate synthetase  29.04 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  28.94 
 
 		 371 aa  99.8  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0556  dihydrodipicolinate synthetase  32.24 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  26.91 
 
 		 301 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  27.99 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  29.64 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  28.45 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  29.78 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  26.43 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  25.69 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.04 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  29.71 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  26.12 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 		 314 aa  96.3  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  29.05 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  27.51 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 290 aa  95.9  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 290 aa  95.9  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  29.78 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1441  dihydrodipicolinate synthetase  27.82 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.681531  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  25.52 
 
 		 297 aa  95.9  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  26.77 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  25.45 
 
 		 289 aa  95.9  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0929  dihydrodipicolinate synthetase  30.36 
 
 		 307 aa  95.9  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.568933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2144  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00221445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  27.43 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  28.44 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  26.88 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  26.99 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8494  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  26.55 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  26.67 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  25.25 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  27.51 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>