More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1441 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1441  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.681531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  80.61 
 
 		 294 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  79.93 
 
 		 294 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6171  dihydrodipicolinate synthetase  68.03 
 
 		 294 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6692  dihydrodipicolinate synthetase  68.03 
 
 		 294 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  62.67 
 
 		 303 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  62.2 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  62.2 
 
 		 291 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  61.17 
 
 		 291 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  32.76 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  31.12 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.9 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  30.71 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  32.67 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  31.49 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  31.49 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  31.49 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  31.49 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  31.49 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  31.49 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  33.59 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  29.93 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  29.9 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  28.28 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  28.87 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  25.52 
 
 		 304 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  26.64 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.98 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.98 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  29.41 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  27.92 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  27.92 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  28.98 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.98 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  27.92 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  28.98 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  27.92 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.22 
 
 		 390 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.22 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  27.86 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.22 
 
 		 305 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  29.11 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  28.57 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  29.39 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  27.5 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.84 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  28.21 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  30.2 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  28.19 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  28.19 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  30.27 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  28.19 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  28.19 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  27.76 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  26.94 
 
 		 298 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  33.19 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  31.34 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  30.37 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  28.23 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  29.64 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.45 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>