More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48000 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 305 aa  623  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  99.34 
 
 		 305 aa  620  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  74.92 
 
 		 306 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  73.86 
 
 		 306 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  73.86 
 
 		 306 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  74.42 
 
 		 390 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  73.86 
 
 		 306 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  73.86 
 
 		 306 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  73.86 
 
 		 306 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  73.2 
 
 		 390 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  71.95 
 
 		 306 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  71.95 
 
 		 306 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  71.95 
 
 		 306 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  71.57 
 
 		 306 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  69.84 
 
 		 309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  47.02 
 
 		 304 aa  315  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  51.37 
 
 		 303 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  46.53 
 
 		 304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  47.35 
 
 		 304 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  48.64 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  46.36 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 304 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  48.99 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  46.03 
 
 		 304 aa  299  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  47.14 
 
 		 301 aa  288  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  48.83 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  46.46 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  45.05 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  45.15 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  44.18 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  44.44 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  40.6 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  41.22 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  40.2 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  40.92 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  42.67 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  43 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  40 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  40.75 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  37.88 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  34.81 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  38.58 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  35.64 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  30.31 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  34.53 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  29.05 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  29.25 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  29.62 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  29.05 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  29.27 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  28.91 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  32.04 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  29.27 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  31.29 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  33.61 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  32.71 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6171  dihydrodipicolinate synthetase  31.23 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.91 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.22 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  30.48 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6692  dihydrodipicolinate synthetase  32.87 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  32.23 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  27.06 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 295 aa  128  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.48 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  27.27 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1441  dihydrodipicolinate synthetase  28.22 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.681531  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>