More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2860 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  608  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  57.19 
 
 		 290 aa  328  8e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  56.23 
 
 		 297 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  54.7 
 
 		 298 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  54.7 
 
 		 298 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  54.7 
 
 		 298 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  54.7 
 
 		 298 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  54.7 
 
 		 298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  54.7 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  50.68 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  52.96 
 
 		 298 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  51.06 
 
 		 293 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  50 
 
 		 293 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 298 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 298 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  51.71 
 
 		 298 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 298 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  51.71 
 
 		 298 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 298 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  49.82 
 
 		 296 aa  285  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  51.65 
 
 		 294 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  51.37 
 
 		 298 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  46.34 
 
 		 295 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  46.71 
 
 		 295 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  46.34 
 
 		 295 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  32.2 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  32.4 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  35.83 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  32.77 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  32.43 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  32.43 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  32.43 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  35.55 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  32.71 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  32.97 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  31.82 
 
 		 304 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  32.28 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  33.33 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  31.67 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  32 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  32.75 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  31.93 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  31.45 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  32.26 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  33.94 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  32.4 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  29.23 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  30.55 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  29.75 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  32.04 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  32.72 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  30.96 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  31.27 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  29.77 
 
 		 304 aa  132  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  29.64 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  29.64 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  29.64 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  29.64 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  30 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  31.36 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.12 
 
 		 390 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  27.93 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6692  dihydrodipicolinate synthetase  30.66 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  27.4 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.57 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.57 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  31.32 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>