More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0965 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0965  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 294 aa  599  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1456  dihydrodipicolinate synthase  73.04 
 
 		 295 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1485  dihydrodipicolinate synthase  73.04 
 
 		 295 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  38.43 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  40.71 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  38.43 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  40.71 
 
 		 291 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  39.24 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  39.79 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 292 aa  212  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  41.3 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  39.46 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  40.13 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  39.52 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  42.5 
 
 		 292 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 291 aa  208  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  41.4 
 
 		 286 aa  209  7e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  39.31 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  39.37 
 
 		 289 aa  208  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  43.12 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  42.45 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  37.5 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  40.29 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  37.15 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  37.41 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 292 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 292 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  40.62 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  39.19 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  39.71 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  38.1 
 
 		 300 aa  198  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  39.44 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  36.46 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  37.67 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  39.8 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  36.11 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  36.46 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  37.68 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  36.08 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  37.33 
 
 		 307 aa  193  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  38.28 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  39.52 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  40.55 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  41.43 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  38.13 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  37.37 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  36.01 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  38.31 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  39.57 
 
 		 314 aa  192  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  39.52 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  37.59 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  39.52 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  38.36 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  39.46 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  39.46 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  37.29 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  38.3 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 290 aa  189  7e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 291 aa  188  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>