More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1020 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1020  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 297 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5643  dihydrodipicolinate synthetase  63.51 
 
 		 297 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0707  dihydrodipicolinate synthetase  67.35 
 
 		 297 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.168869  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0696  dihydrodipicolinate synthetase  66.33 
 
 		 297 aa  331  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  55.05 
 
 		 296 aa  305  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5078  dihydrodipicolinate synthetase  51.7 
 
 		 308 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1329  dihydrodipicolinate synthetase  55.22 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3294  dihydrodipicolinate synthetase  50.34 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2534  dihydrodipicolinate synthetase  54.35 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2793  dihydrodipicolinate synthetase  56.34 
 
 		 308 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1729  dihydrodipicolinate synthetase  48.31 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426796  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1901  dihydrodipicolinate synthetase  50.51 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2014  dihydrodipicolinate synthetase  46.62 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09540  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  46.05 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.345365  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21260  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  36.24 
 
 		 559 aa  179  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.175534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1188  dihydrodipicolinate synthetase  31.86 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0108219  normal  0.0299007 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  37.33 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  37.21 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  35.52 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  34.39 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  35.21 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  35.05 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.59 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  36.77 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  36.77 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  35.93 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  35.79 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  36.64 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  36.64 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  36.04 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  37.2 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  36.64 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  31.79 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  32.5 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  31.79 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  37.04 
 
 		 292 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  34.23 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  35.36 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.79 
 
 		 290 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  33.11 
 
 		 295 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  31.69 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  33.69 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  34.52 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  36.16 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  37.8 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  35.46 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  33.21 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  35.46 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  35.13 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  34.07 
 
 		 295 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  34.07 
 
 		 295 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  32.58 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  34.24 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  32.2 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  36.15 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  32.28 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  32.83 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  32.84 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  30.18 
 
 		 290 aa  119  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  32.95 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  32.83 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  31.35 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  34.4 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  31.53 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  34.16 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  31.37 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4773  dihydrodipicolinate synthetase  30.69 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164682 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  30.5 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  32.72 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  31.67 
 
 		 290 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  29.88 
 
 		 298 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  30.43 
 
 		 294 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  29.52 
 
 		 292 aa  115  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  34.51 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  34.92 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>