More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2534 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2534  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
308 aa  617  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2793  dihydrodipicolinate synthetase  82.79 
 
 
308 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616024  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  61.32 
 
 
296 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5078  dihydrodipicolinate synthetase  59.79 
 
 
308 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3294  dihydrodipicolinate synthetase  59.71 
 
 
299 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0707  dihydrodipicolinate synthetase  54.58 
 
 
297 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.168869  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0696  dihydrodipicolinate synthetase  54.23 
 
 
297 aa  267  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5643  dihydrodipicolinate synthetase  54.23 
 
 
297 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1329  dihydrodipicolinate synthetase  56.23 
 
 
295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1020  dihydrodipicolinate synthetase  54.35 
 
 
297 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1901  dihydrodipicolinate synthetase  49.13 
 
 
296 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1729  dihydrodipicolinate synthetase  42.86 
 
 
296 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426796  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2014  dihydrodipicolinate synthetase  45.17 
 
 
306 aa  195  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21260  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  35.02 
 
 
559 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.175534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09540  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  40.69 
 
 
301 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.345365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1188  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 
350 aa  142  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0108219  normal  0.0299007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 
298 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  34.29 
 
 
292 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 
293 aa  119  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  34.34 
 
 
298 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  31.2 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  31.5 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  31.5 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  31.5 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  39.25 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  31.5 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  31.5 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  30.1 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  34.4 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  31.5 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  31.5 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  31.5 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  32.51 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  36.21 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  34.19 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  33.47 
 
 
292 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  30.14 
 
 
303 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.85 
 
 
293 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.03 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 
292 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  30.5 
 
 
303 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 
298 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  28.63 
 
 
298 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 
298 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 
298 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  38.51 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  38.51 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  34.97 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  34.97 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  30.2 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 
298 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 
298 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  28.63 
 
 
298 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  27.82 
 
 
298 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 
292 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 
298 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  29.79 
 
 
302 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 
297 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 
298 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 
287 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 
292 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  32.2 
 
 
292 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 
295 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  32.19 
 
 
290 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 
298 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 
298 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.82 
 
 
294 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 
298 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  31.79 
 
 
303 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 
295 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  31.78 
 
 
292 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 
326 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 
291 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 
294 aa  106  6e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  30.62 
 
 
292 aa  105  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  31.43 
 
 
290 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.82 
 
 
294 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3836  dihydrodipicolinate synthase, putative  36.41 
 
 
206 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  30.93 
 
 
293 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 
291 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  33.18 
 
 
293 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 
303 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  29.55 
 
 
298 aa  102  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 
290 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 
298 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  32.49 
 
 
295 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  29.96 
 
 
290 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  32.34 
 
 
295 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  30.36 
 
 
305 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  33.05 
 
 
295 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>