More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1729 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1729  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426796  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1901  dihydrodipicolinate synthetase  57.29 
 
 		 296 aa  290  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2014  dihydrodipicolinate synthetase  58.9 
 
 		 306 aa  289  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5078  dihydrodipicolinate synthetase  46.78 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  46.13 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5643  dihydrodipicolinate synthetase  46.98 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0696  dihydrodipicolinate synthetase  51.69 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0707  dihydrodipicolinate synthetase  51.7 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.168869  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09540  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  47.65 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.345365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1020  dihydrodipicolinate synthetase  48.31 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1329  dihydrodipicolinate synthetase  47.41 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2534  dihydrodipicolinate synthetase  44.6 
 
 		 308 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2793  dihydrodipicolinate synthetase  45.19 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3294  dihydrodipicolinate synthetase  46.27 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21260  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  38.67 
 
 		 559 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.175534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1188  dihydrodipicolinate synthetase  35.38 
 
 		 350 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0108219  normal  0.0299007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.74 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  29.73 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  27.66 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  28.01 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  29.61 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  32.13 
 
 		 296 aa  99  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  30.21 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  28.04 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.25 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  29.37 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.25 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  29.01 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 		 292 aa  95.9  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 298 aa  95.9  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  30.43 
 
 		 293 aa  95.5  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1441  dihydrodipicolinate synthetase  29.77 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.681531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  29.27 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  26.8 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  31.45 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  29.27 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  31.3 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  31.52 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  32.5 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  28.37 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  30.97 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  30.97 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 298 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  31.3 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  28.19 
 
 		 294 aa  92.4  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  31.65 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  28.19 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 296 aa  92.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  29.85 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6692  dihydrodipicolinate synthetase  30.67 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  27.65 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  31.87 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  28.19 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 295 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  26.82 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  30.65 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  27.94 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 295 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5823  dihydrodipicolinate synthase  31.95 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  27.94 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  29.2 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  25.67 
 
 		 297 aa  89.4  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  29.7 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  33.88 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>