More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1901 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1901  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2014  dihydrodipicolinate synthetase  66.78 
 
 		 306 aa  332  7.000000000000001e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1729  dihydrodipicolinate synthetase  57.29 
 
 		 296 aa  305  8.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426796  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  48.82 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5078  dihydrodipicolinate synthetase  48.81 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1329  dihydrodipicolinate synthetase  53.56 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09540  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  48.66 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.345365  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0696  dihydrodipicolinate synthetase  51.18 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2534  dihydrodipicolinate synthetase  49.13 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0707  dihydrodipicolinate synthetase  51.52 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.168869  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5643  dihydrodipicolinate synthetase  47.47 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3294  dihydrodipicolinate synthetase  47.32 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1020  dihydrodipicolinate synthetase  50.51 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2793  dihydrodipicolinate synthetase  47.74 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21260  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  38.38 
 
 		 559 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.175534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1188  dihydrodipicolinate synthetase  35.23 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0108219  normal  0.0299007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  28.41 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  32.01 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.1 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  29.43 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  38.67 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  29.52 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  29.13 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  34.62 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  29.13 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  28.21 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 292 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  31.09 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  31.09 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  28.24 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  38.41 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  28.14 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  38.41 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  29.96 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  27.91 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  29.6 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  36.18 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  29.46 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  29.85 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.48 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.48 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.41 
 
 		 298 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 		 297 aa  89.4  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  29.22 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  25.5 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  25.5 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  28.4 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  29.2 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  29.32 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  29.03 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  27.97 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  29.05 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  25 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  30.15 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  35.53 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  35.53 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  29.46 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>