More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21260  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 559 aa  1071    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.175534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1188  dihydrodipicolinate synthetase  48.84 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0108219  normal  0.0299007 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  37.33 
 
 		 296 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3294  dihydrodipicolinate synthetase  36.24 
 
 		 299 aa  158  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5078  dihydrodipicolinate synthetase  32.55 
 
 		 308 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2014  dihydrodipicolinate synthetase  38.97 
 
 		 306 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1329  dihydrodipicolinate synthetase  37.27 
 
 		 295 aa  153  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1729  dihydrodipicolinate synthetase  38.67 
 
 		 296 aa  153  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426796  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1020  dihydrodipicolinate synthetase  36.4 
 
 		 297 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2534  dihydrodipicolinate synthetase  36.3 
 
 		 308 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0696  dihydrodipicolinate synthetase  34.58 
 
 		 297 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0707  dihydrodipicolinate synthetase  35.44 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.168869  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5643  dihydrodipicolinate synthetase  33.67 
 
 		 297 aa  144  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1901  dihydrodipicolinate synthetase  38.59 
 
 		 296 aa  144  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09540  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  40.61 
 
 		 301 aa  141  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.345365  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2793  dihydrodipicolinate synthetase  34.34 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  30.9 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  31.16 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  31.56 
 
 		 295 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 293 aa  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  29.53 
 
 		 298 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  30.79 
 
 		 296 aa  100  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  29.19 
 
 		 298 aa  98.6  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  29.77 
 
 		 290 aa  97.8  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 		 294 aa  97.1  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.29 
 
 		 297 aa  97.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  27.59 
 
 		 291 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  30.99 
 
 		 298 aa  95.9  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 298 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  29.07 
 
 		 304 aa  95.1  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  29.54 
 
 		 291 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  31.62 
 
 		 298 aa  94.4  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 298 aa  94.4  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  31.62 
 
 		 298 aa  94.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 298 aa  94.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 298 aa  94.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 298 aa  94.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  29.54 
 
 		 294 aa  93.6  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  27.24 
 
 		 291 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  29.48 
 
 		 303 aa  93.2  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 303 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  31.4 
 
 		 296 aa  91.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 298 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 298 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  32.63 
 
 		 294 aa  90.9  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  28.38 
 
 		 293 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.04 
 
 		 293 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 294 aa  89  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  29.02 
 
 		 286 aa  89.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  29.67 
 
 		 292 aa  89  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.19 
 
 		 293 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 298 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 298 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  25.84 
 
 		 303 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.83 
 
 		 294 aa  88.2  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  30.53 
 
 		 298 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 298 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 298 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1978  dihydrodipicolinate synthetase  33.78 
 
 		 297 aa  86.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 298 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  27.87 
 
 		 305 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 298 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 298 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1441  dihydrodipicolinate synthetase  28.2 
 
 		 294 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.681531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  26.42 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  30.49 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  26.42 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  26.2 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  27.15 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  26.47 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.93 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  25.98 
 
 		 299 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6692  dihydrodipicolinate synthetase  30.31 
 
 		 294 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 		 289 aa  82.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  30.53 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  28.03 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  27.44 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  26.49 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  26.49 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  26.49 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  26.49 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  26.49 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  26.49 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  26.49 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4989  dihydrodipicolinate synthetase  32.95 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  28.09 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>