More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4110 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 307 aa  614  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  65.53 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  62.24 
 
 		 310 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  53.45 
 
 		 297 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  53.45 
 
 		 304 aa  285  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  42.72 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  36.18 
 
 		 304 aa  195  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  37.45 
 
 		 304 aa  191  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  35.62 
 
 		 304 aa  185  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  39.78 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  36.49 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  38.52 
 
 		 304 aa  182  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  39.12 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  35.96 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  38.69 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  37.74 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  36.97 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  36.97 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  38.58 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  36.97 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  38.11 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  37.05 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  37.41 
 
 		 390 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  39.58 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  32.98 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  37.41 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  37.45 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  37.41 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  37.41 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  37.41 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  37.41 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  37.41 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  35.15 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  36.33 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  37.59 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  35.48 
 
 		 304 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  37.21 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  31.82 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  32.06 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  32.9 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  35.25 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  32.67 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  32.04 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  31.65 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  29.58 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  29.58 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  36.95 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  29.92 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  28.78 
 
 		 298 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.77 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  36.02 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  30.69 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  36.36 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  30.34 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  29.63 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  32.02 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  32.08 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.51 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.88 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  31.67 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.98 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  31.71 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  29.93 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  30.69 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.18 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  28.92 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  32.06 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  28.66 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  30.45 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 291 aa  123  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  35.11 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  29.93 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  31.52 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  29.05 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  27.52 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  31.27 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  33.8 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  29.73 
 
 		 290 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0309  dihydrodipicolinate synthetase  31.99 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.9 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  28.24 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  29.51 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  29 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  28.47 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  31.6 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>