More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0309 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0309  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
303 aa  609  1e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1812  dihydrodipicolinate synthetase  94.68 
 
 
301 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.973565  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0992  dihydrodipicolinate synthetase  86.71 
 
 
301 aa  545  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.673974  hitchhiker  0.00851435 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0350  dihydrodipicolinate synthase  83.97 
 
 
308 aa  507  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 
301 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.33 
 
 
308 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.46 
 
 
290 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.58 
 
 
313 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  31.44 
 
 
298 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  32.89 
 
 
291 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  32.78 
 
 
294 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 
298 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 
298 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  32.41 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 
298 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.65 
 
 
291 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  28.95 
 
 
295 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.03 
 
 
301 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
292 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  29.63 
 
 
298 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 
297 aa  142  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  29.53 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  32.21 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  30.87 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  31.89 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  29.67 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.52 
 
 
313 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
293 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  29.57 
 
 
292 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  28.23 
 
 
290 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 
288 aa  136  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  29.84 
 
 
296 aa  136  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  29.32 
 
 
371 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 
289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  28.91 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  29.53 
 
 
291 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  32.03 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  28.09 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  29.63 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  29.7 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  29.63 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  32 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  27.91 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  27.91 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.62 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  27.95 
 
 
296 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  28.2 
 
 
297 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  30.42 
 
 
298 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  30.99 
 
 
297 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 
294 aa  130  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  27.76 
 
 
289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  29.63 
 
 
293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  32.32 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 
294 aa  129  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  28.09 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1917  dihydrodipicolinate synthetase  33.23 
 
 
299 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  30.3 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  31.82 
 
 
302 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 
313 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 
292 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  30.99 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  27.52 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  30.2 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
319 aa  126  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 
294 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 
309 aa  125  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 
297 aa  125  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 
297 aa  125  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  29.19 
 
 
296 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  29.97 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  31.79 
 
 
301 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  32.38 
 
 
291 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  32 
 
 
294 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  29.63 
 
 
295 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 
304 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  28.85 
 
 
298 aa  123  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 
296 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  29.53 
 
 
293 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  29.63 
 
 
292 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 
316 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 
296 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  33.06 
 
 
293 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  28.71 
 
 
306 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 
316 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 
303 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 
316 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  26.94 
 
 
293 aa  123  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  27.69 
 
 
296 aa  123  5e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
291 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  27.76 
 
 
293 aa  122  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>