More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1630 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  100 
 
 
309 aa  627  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  88.67 
 
 
309 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  86.73 
 
 
309 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  87.01 
 
 
309 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  86.69 
 
 
309 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  83.5 
 
 
309 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  84.04 
 
 
313 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5216  dihydrodipicolinate synthetase  86.73 
 
 
309 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  86.73 
 
 
309 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4586  dihydrodipicolinate synthetase  86.41 
 
 
309 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115595 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  83.01 
 
 
313 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  80.84 
 
 
312 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  80.2 
 
 
305 aa  514  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  77.67 
 
 
309 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  78.81 
 
 
309 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  75.08 
 
 
316 aa  482  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  76.57 
 
 
309 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  76.16 
 
 
305 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  70.13 
 
 
310 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  71.43 
 
 
310 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3057  dihydrodipicolinate synthetase  71.85 
 
 
305 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4375  dihydrodipicolinate synthetase  72.52 
 
 
305 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5056  dihydrodipicolinate synthetase  72.19 
 
 
305 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5804  dihydrodipicolinate synthetase  72.19 
 
 
305 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5070  dihydrodipicolinate synthetase  71.19 
 
 
305 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903203  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3210  dihydrodipicolinate synthetase  70.53 
 
 
305 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  71.34 
 
 
308 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2738  dihydrodipicolinate synthetase  71.01 
 
 
309 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2133  dihydrodipicolinate synthase  68.28 
 
 
309 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6235  dihydrodipicolinate synthetase  69.54 
 
 
311 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6404  dihydrodipicolinate synthetase  69.54 
 
 
311 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3398  dihydrodipicolinate synthetase  69.54 
 
 
311 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6637  dihydrodipicolinate synthetase  69.54 
 
 
311 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207106  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  70 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  56.45 
 
 
310 aa  348  9e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  56.91 
 
 
309 aa  340  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  55.34 
 
 
303 aa  324  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  32.17 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  34.26 
 
 
311 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  29.48 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  31.68 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  32.55 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  31.77 
 
 
308 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  31.44 
 
 
308 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  32.01 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  31.88 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  32.18 
 
 
308 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  32.47 
 
 
295 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  30.85 
 
 
310 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  28.46 
 
 
298 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 
298 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 
298 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 
298 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 
298 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 
298 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  28.05 
 
 
298 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 
298 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  30.69 
 
 
317 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  26.44 
 
 
297 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  29.7 
 
 
317 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  27.18 
 
 
303 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 
298 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 
298 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 
298 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 
298 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  30.79 
 
 
311 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 
298 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  30.03 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  29.25 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.76 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  30.53 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  27.48 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  30.25 
 
 
295 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  31.45 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  27.27 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.96 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.37 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  25.82 
 
 
305 aa  92.8  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  28.88 
 
 
300 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3385  dihydrodipicolinate synthetase  28.01 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341407  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1536  dihydrodipicolinate synthetase  28.9 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.619521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  29.53 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  31.01 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  29.04 
 
 
306 aa  89  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.24 
 
 
304 aa  89  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  27.61 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  27.15 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  25.94 
 
 
302 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3593  dihydrodipicolinate synthetase  30.86 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  24.31 
 
 
298 aa  85.9  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  26.25 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  25.16 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  27.13 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>