More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0707 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 300 aa  620  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  29.86 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  31.05 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  26.67 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  29.72 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  31.41 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  30.07 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  28.24 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  29.02 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  29.02 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  29.24 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  28.66 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3541  dihydrodipicolinate synthetase  26.44 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  27.95 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  29.47 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  28.24 
 
 		 317 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1536  dihydrodipicolinate synthetase  27.49 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.619521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  30.32 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.63 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.14 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  25.82 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  25.3 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  28.33 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  28.15 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.81 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  29.96 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  26.56 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  36.67 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0309  dihydrodipicolinate synthetase  30.52 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  29.6 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  27.53 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  26.78 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  24.17 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  26.14 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  28.88 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  26.15 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1812  dihydrodipicolinate synthetase  30.12 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.973565  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  29.76 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  29.93 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  29.07 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  28.7 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  26.76 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  21.58 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  29.06 
 
 		 293 aa  90.1  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  28.52 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  24.07 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  24.58 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  26.61 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  23.33 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  26.67 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  28.16 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2975  dihydrodipicolinate synthetase  25.83 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.696514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  26.67 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  27.91 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  27.04 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  26.42 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  28.83 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3940  dihydrodipicolinate synthetase  30.11 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  25.84 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  26.19 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  23.6 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  24.27 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  25.75 
 
 		 306 aa  85.5  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  24.73 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  26.02 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  26.02 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  26.02 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  21.53 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  26.02 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  25.49 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0992  dihydrodipicolinate synthetase  27.53 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.673974  hitchhiker  0.00851435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  24.37 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  24.03 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  25.49 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2368  dihydrodipicolinate synthetase  26.72 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  26.38 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  27.32 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  25.89 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  26.26 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  22.18 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  27.47 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  27.44 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  27.47 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  25 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  27.76 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2942  dihydrodipicolinate synthetase  28.67 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.340616  normal  0.0534802 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0350  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  24.89 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>