More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3940 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3940  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 308 aa  593  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  38.18 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  31.68 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  31.86 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  32.16 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  32.31 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  32.88 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  31.86 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  32.49 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  30.69 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  30.36 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  31.74 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  29.45 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3308  dihydrodipicolinate synthetase  35.93 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  32.54 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3593  dihydrodipicolinate synthetase  32.21 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2738  dihydrodipicolinate synthetase  32.76 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200643  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  30.23 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.87 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  28.32 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  30.14 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  32.06 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  31.21 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  30.66 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  31.4 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  30.14 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1078  dihydrodipicolinate synthetase  35.87 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  29.82 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.7 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  31.27 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  31.4 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  31.6 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3385  dihydrodipicolinate synthetase  30.79 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  30.5 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  29.25 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  30.07 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4586  dihydrodipicolinate synthetase  32.4 
 
 		 309 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  29.72 
 
 		 317 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  29.01 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  30.13 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  28.33 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5216  dihydrodipicolinate synthetase  32.06 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  32.06 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  30.18 
 
 		 311 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6404  dihydrodipicolinate synthetase  30.95 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6235  dihydrodipicolinate synthetase  30.95 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  30.1 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6637  dihydrodipicolinate synthetase  30.95 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  27.91 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  29.73 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  31.06 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2133  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3398  dihydrodipicolinate synthetase  29.59 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  28.96 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  27.76 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5070  dihydrodipicolinate synthetase  30.79 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5056  dihydrodipicolinate synthetase  31.02 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5804  dihydrodipicolinate synthetase  31.02 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4375  dihydrodipicolinate synthetase  31.35 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3057  dihydrodipicolinate synthetase  30.79 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3210  dihydrodipicolinate synthetase  30.13 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1485  dihydrodipicolinate synthetase  33.1 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.177737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  27.16 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  25.34 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3541  dihydrodipicolinate synthetase  27.46 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  25.6 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  33.73 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  25.96 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  25.96 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  25.67 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  25.18 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  29.73 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  26.75 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  29.05 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  25.89 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.45 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  26.44 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  31.68 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  26.42 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  25.65 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  25.65 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  25.65 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  25.64 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  27.5 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>