More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3658 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  96.45 
 
 		 310 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  62.58 
 
 		 311 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  60.33 
 
 		 312 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  58.47 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  56.81 
 
 		 308 aa  340  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  56.48 
 
 		 317 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  59.8 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  57.48 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1485  dihydrodipicolinate synthetase  56.72 
 
 		 302 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.177737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  57.81 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  54.75 
 
 		 308 aa  328  8e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  56.81 
 
 		 308 aa  328  9e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  54.75 
 
 		 308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  58.8 
 
 		 311 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  53.44 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  54.28 
 
 		 308 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3385  dihydrodipicolinate synthetase  55.15 
 
 		 317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  43.64 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1078  dihydrodipicolinate synthetase  38.79 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3308  dihydrodipicolinate synthetase  39.22 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  31.21 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  32.07 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  31.32 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  33.09 
 
 		 310 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  30.5 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  29.72 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  30.6 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  30.6 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  32.74 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3593  dihydrodipicolinate synthetase  27.93 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  28.37 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  28.37 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  29.97 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  30.85 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  30.88 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  31.91 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2133  dihydrodipicolinate synthase  32.73 
 
 		 309 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  29.76 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  29.41 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  32.73 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  30.58 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  27.7 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  31.45 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6235  dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  28.66 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6404  dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3398  dihydrodipicolinate synthetase  31.1 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6637  dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  29.8 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  28.01 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  27.12 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  28.34 
 
 		 289 aa  92.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5216  dihydrodipicolinate synthetase  30.03 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  30.03 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  27.94 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  28.71 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  33.13 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4586  dihydrodipicolinate synthetase  29.69 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  29.39 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  25.82 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2738  dihydrodipicolinate synthetase  30.39 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  25.36 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  30.84 
 
 		 303 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  29.81 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  27.13 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  28.63 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  29.53 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  26.91 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  31.87 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3940  dihydrodipicolinate synthetase  29.71 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  25.51 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5070  dihydrodipicolinate synthetase  30.04 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  30.12 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  30.89 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  24.72 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  28.2 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  25.27 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3210  dihydrodipicolinate synthetase  30.04 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3057  dihydrodipicolinate synthetase  29.68 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  30.8 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  24.91 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  25.89 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.92 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  27.89 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  27.09 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>