More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2738 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2738  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 309 aa  621  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200643  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  72.55 
 
 		 313 aa  454  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  72.85 
 
 		 313 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  71.24 
 
 		 309 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  72.49 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  71.19 
 
 		 305 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  71.95 
 
 		 310 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  70.87 
 
 		 309 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  71.01 
 
 		 309 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  71.76 
 
 		 309 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  71.52 
 
 		 309 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  71.2 
 
 		 309 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  70.55 
 
 		 309 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  77 
 
 		 308 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  69.9 
 
 		 309 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  68.3 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  69.87 
 
 		 312 aa  428  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2133  dihydrodipicolinate synthase  71.8 
 
 		 309 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  70.55 
 
 		 310 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  68.09 
 
 		 309 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4586  dihydrodipicolinate synthetase  70.23 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115595 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5216  dihydrodipicolinate synthetase  70.55 
 
 		 309 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3398  dihydrodipicolinate synthetase  71.33 
 
 		 311 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  70.55 
 
 		 309 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  69.44 
 
 		 305 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6235  dihydrodipicolinate synthetase  71.33 
 
 		 311 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6404  dihydrodipicolinate synthetase  71.33 
 
 		 311 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6637  dihydrodipicolinate synthetase  71.33 
 
 		 311 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3057  dihydrodipicolinate synthetase  70.1 
 
 		 305 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5056  dihydrodipicolinate synthetase  69.77 
 
 		 305 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3210  dihydrodipicolinate synthetase  70.1 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5070  dihydrodipicolinate synthetase  70.1 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5804  dihydrodipicolinate synthetase  69.77 
 
 		 305 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4375  dihydrodipicolinate synthetase  69.44 
 
 		 305 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  60.06 
 
 		 310 aa  363  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  59.93 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  57.33 
 
 		 303 aa  341  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  32.27 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  31.1 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  26.91 
 
 		 317 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  30.36 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  32 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  30.39 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  31.56 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  32.26 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  31.9 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  32.59 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3940  dihydrodipicolinate synthetase  31.39 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1536  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.619521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  27.2 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  29.39 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  26.72 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  27.13 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  33.07 
 
 		 306 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 317 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  29.47 
 
 		 317 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  30.99 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  25.7 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  29.19 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  29.9 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  32.24 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  30.22 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  33.52 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  26.1 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  25.3 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  27 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  29.02 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.52 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.41 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  27.6 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  29.14 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3593  dihydrodipicolinate synthetase  31.45 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.12 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  28.48 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  29.93 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.76 
 
 		 297 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  25.76 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3385  dihydrodipicolinate synthetase  29.08 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  25.42 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  26.09 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  29.93 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  29.81 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  27.39 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  31.14 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  26.6 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  29.58 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  29.03 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  29.85 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  26.51 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>