More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2707 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 316 aa  653    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  80.58 
 
 		 309 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  82.12 
 
 		 309 aa  518  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  79.47 
 
 		 305 aa  507  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  82.12 
 
 		 305 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  80.2 
 
 		 312 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  78.55 
 
 		 313 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  77.56 
 
 		 313 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  75.4 
 
 		 309 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  75.65 
 
 		 309 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  75.4 
 
 		 309 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  73.46 
 
 		 309 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  75.65 
 
 		 309 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  75.08 
 
 		 309 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5216  dihydrodipicolinate synthetase  75.73 
 
 		 309 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  75.73 
 
 		 309 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  73.44 
 
 		 309 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4586  dihydrodipicolinate synthetase  75.4 
 
 		 309 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  73 
 
 		 310 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  70.43 
 
 		 310 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  70.76 
 
 		 310 aa  421  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2133  dihydrodipicolinate synthase  69.9 
 
 		 309 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3057  dihydrodipicolinate synthetase  67.88 
 
 		 305 aa  417  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  72.43 
 
 		 308 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3210  dihydrodipicolinate synthetase  67.88 
 
 		 305 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5056  dihydrodipicolinate synthetase  68.54 
 
 		 305 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5070  dihydrodipicolinate synthetase  68.21 
 
 		 305 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5804  dihydrodipicolinate synthetase  68.54 
 
 		 305 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4375  dihydrodipicolinate synthetase  68.21 
 
 		 305 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2738  dihydrodipicolinate synthetase  68.3 
 
 		 309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200643  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3398  dihydrodipicolinate synthetase  68.21 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6404  dihydrodipicolinate synthetase  67.55 
 
 		 311 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6637  dihydrodipicolinate synthetase  67.55 
 
 		 311 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6235  dihydrodipicolinate synthetase  67.55 
 
 		 311 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  55.63 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  56.25 
 
 		 309 aa  341  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  54.28 
 
 		 303 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  35.36 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  34.06 
 
 		 295 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  31.65 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  32.62 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  32.28 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  32.16 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  32.16 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  31.21 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  32.97 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  29.3 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  27.84 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  27.49 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  30.16 
 
 		 317 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  27.49 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  31.11 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  32.98 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  32.39 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  31.1 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  31.9 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  29.81 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.82 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  30.49 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  32.04 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  27.53 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  31.9 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3385  dihydrodipicolinate synthetase  30.07 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 293 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  29.18 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.92 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  29.23 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  29.23 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  29.23 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  29.02 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  29.82 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1536  dihydrodipicolinate synthetase  28.33 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.619521 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  29.93 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  29.93 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  26.54 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1485  dihydrodipicolinate synthetase  32.49 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.177737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  27.44 
 
 		 341 aa  92.4  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3940  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  28.36 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>