More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5070 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5070  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 305 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3210  dihydrodipicolinate synthetase  98.69 
 
 		 305 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3057  dihydrodipicolinate synthetase  95.08 
 
 		 305 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5056  dihydrodipicolinate synthetase  94.1 
 
 		 305 aa  567  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5804  dihydrodipicolinate synthetase  94.1 
 
 		 305 aa  567  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4375  dihydrodipicolinate synthetase  94.43 
 
 		 305 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  71.62 
 
 		 309 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  70.72 
 
 		 305 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  70.72 
 
 		 309 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  71.38 
 
 		 309 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  71.15 
 
 		 312 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  71.19 
 
 		 313 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  72.43 
 
 		 309 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  70.72 
 
 		 309 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  72.76 
 
 		 309 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  71.52 
 
 		 309 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  72.46 
 
 		 305 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  71.52 
 
 		 309 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  71.19 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  70.53 
 
 		 313 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  68.21 
 
 		 316 aa  438  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  68.77 
 
 		 310 aa  431  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  74.42 
 
 		 308 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5216  dihydrodipicolinate synthetase  72.19 
 
 		 309 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  72.19 
 
 		 309 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4586  dihydrodipicolinate synthetase  71.85 
 
 		 309 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  69.64 
 
 		 310 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  70.43 
 
 		 310 aa  418  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2133  dihydrodipicolinate synthase  68.77 
 
 		 309 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2738  dihydrodipicolinate synthetase  70.1 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200643  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6235  dihydrodipicolinate synthetase  65.9 
 
 		 311 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6404  dihydrodipicolinate synthetase  65.9 
 
 		 311 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3398  dihydrodipicolinate synthetase  66.23 
 
 		 311 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6637  dihydrodipicolinate synthetase  65.9 
 
 		 311 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  57.28 
 
 		 309 aa  332  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  57.57 
 
 		 310 aa  331  8e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  56.39 
 
 		 303 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  32.61 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  32.28 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  28.09 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  33.57 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  31.72 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  32.89 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  31.49 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  31.14 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  27.06 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  27.31 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  27.13 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  31.14 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  30.39 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  26.51 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  26.1 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  32.58 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  26.72 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  32.58 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  26.72 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  26.72 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  32.58 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  30.04 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  28.83 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.81 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  34.81 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  32.26 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.33 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.67 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  31.18 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  30.1 
 
 		 317 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  30 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  28.47 
 
 		 293 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  26.64 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  29.03 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  28.92 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 317 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3593  dihydrodipicolinate synthetase  30.69 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  28.8 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  28.35 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3385  dihydrodipicolinate synthetase  29.14 
 
 		 317 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  27.82 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  27.89 
 
 		 290 aa  85.9  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00126  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  27.45 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  28.82 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  26.51 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  27.76 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  28.69 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  30.37 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  28 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1536  dihydrodipicolinate synthetase  29.21 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.619521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>