More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2247 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  100 
 
 		 312 aa  638    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  84.57 
 
 		 313 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  84.69 
 
 		 313 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  82.84 
 
 		 305 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  80.84 
 
 		 309 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  81.13 
 
 		 309 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  81.43 
 
 		 309 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  80.13 
 
 		 309 aa  507  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  81.85 
 
 		 309 aa  505  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  80.2 
 
 		 316 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  79.74 
 
 		 309 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  80.07 
 
 		 309 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  78.15 
 
 		 309 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  77.81 
 
 		 309 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4586  dihydrodipicolinate synthetase  79.8 
 
 		 309 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115595 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5216  dihydrodipicolinate synthetase  80.13 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  80.13 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  78.81 
 
 		 305 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  71.67 
 
 		 310 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3057  dihydrodipicolinate synthetase  70.49 
 
 		 305 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  71.1 
 
 		 310 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3210  dihydrodipicolinate synthetase  70.82 
 
 		 305 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5070  dihydrodipicolinate synthetase  71.15 
 
 		 305 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5056  dihydrodipicolinate synthetase  69.84 
 
 		 305 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4375  dihydrodipicolinate synthetase  69.51 
 
 		 305 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5804  dihydrodipicolinate synthetase  69.84 
 
 		 305 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  71.01 
 
 		 310 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2133  dihydrodipicolinate synthase  71.43 
 
 		 309 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  70.43 
 
 		 308 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3398  dihydrodipicolinate synthetase  70.53 
 
 		 311 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6235  dihydrodipicolinate synthetase  69.21 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6404  dihydrodipicolinate synthetase  69.21 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2738  dihydrodipicolinate synthetase  69.87 
 
 		 309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200643  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6637  dihydrodipicolinate synthetase  69.21 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  60.6 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  56.25 
 
 		 309 aa  344  8.999999999999999e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  58.47 
 
 		 303 aa  342  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  34.17 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  34.49 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  32.73 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  33.44 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  32.28 
 
 		 312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  32.3 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  32.4 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  32.23 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  33.57 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  32.05 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  31.72 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  33.68 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  31.31 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  31.73 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  31.32 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.93 
 
 		 317 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  32.62 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  31.65 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.17 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  33.46 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  30.92 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  30.52 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  31.05 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  29.14 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3385  dihydrodipicolinate synthetase  32.04 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.42 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  28.46 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  27.94 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  27.64 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  27.64 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  31.58 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  31.14 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  29.3 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  30.92 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  29.01 
 
 		 390 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  32.4 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  29.55 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1536  dihydrodipicolinate synthetase  29.79 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.619521 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.01 
 
 		 390 aa  96.3  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  31.05 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  30.89 
 
 		 302 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  28 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.63 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.63 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  28.63 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  28.63 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.63 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  27.86 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  28.24 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  28.24 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  28.24 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  28.24 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>