More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3779 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 295 aa  577  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  43.64 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  42.96 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  44.18 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  43.49 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  39.52 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  43.15 
 
 		 307 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  42.96 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  42.27 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  42.47 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  40.27 
 
 		 317 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  41.5 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  40.41 
 
 		 317 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  39.73 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  40.75 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3385  dihydrodipicolinate synthetase  39.39 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  41.44 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1485  dihydrodipicolinate synthetase  41.03 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.177737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  32.87 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  34.27 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  34.06 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  34.17 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  32.73 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  32.87 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  32.14 
 
 		 309 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  31.96 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  32.87 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  33.45 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  32.17 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  32.99 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  34.93 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  32.17 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.11 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  34.15 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1078  dihydrodipicolinate synthetase  34.67 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  31.12 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  34.66 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  31.58 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5216  dihydrodipicolinate synthetase  33.57 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  31.72 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  33.57 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2133  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4586  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3308  dihydrodipicolinate synthetase  35.77 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 297 aa  118  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  30.33 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  32.31 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2738  dihydrodipicolinate synthetase  32.27 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  29.35 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5056  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5804  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4375  dihydrodipicolinate synthetase  32.64 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  29.86 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.231 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  28.87 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  28.87 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3593  dihydrodipicolinate synthetase  29.86 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3940  dihydrodipicolinate synthetase  36.94 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6235  dihydrodipicolinate synthetase  31.72 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  29.25 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.74 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6404  dihydrodipicolinate synthetase  31.72 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6637  dihydrodipicolinate synthetase  31.72 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3210  dihydrodipicolinate synthetase  32.97 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3057  dihydrodipicolinate synthetase  32.61 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5070  dihydrodipicolinate synthetase  32.61 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  27.89 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.2 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3398  dihydrodipicolinate synthetase  31.72 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  29.1 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1536  dihydrodipicolinate synthetase  32.38 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.619521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  28.14 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  31.45 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  24.5 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  30.46 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.92 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  24.66 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  29.44 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  24.32 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30.29 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  24.7 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  32.03 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  27.74 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  24.66 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  24.91 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  24.91 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  23.99 
 
 		 298 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  23.99 
 
 		 298 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  23.99 
 
 		 298 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>