More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7578 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 309 aa  617  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  82.52 
 
 		 312 aa  510  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  76.13 
 
 		 311 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  71.34 
 
 		 317 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  71.2 
 
 		 317 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  72.73 
 
 		 308 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  71.34 
 
 		 317 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  71.52 
 
 		 317 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  71.1 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3385  dihydrodipicolinate synthetase  69.9 
 
 		 317 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  60.13 
 
 		 310 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  59.8 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1485  dihydrodipicolinate synthetase  58.11 
 
 		 302 aa  327  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.177737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  53.14 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  51.51 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  51.51 
 
 		 308 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  51.51 
 
 		 307 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  52.84 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  42.47 
 
 		 295 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  31.9 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3308  dihydrodipicolinate synthetase  32.35 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  30.95 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  31.14 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  30.1 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  28.15 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1078  dihydrodipicolinate synthetase  35.23 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  29.76 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  27.85 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  27.96 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  30.95 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  27.6 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  26.3 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  28.52 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  27.85 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3940  dihydrodipicolinate synthetase  30.63 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  30.47 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  27.52 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  27.85 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  30.47 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  29.53 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3593  dihydrodipicolinate synthetase  27.4 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  27.52 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  26.09 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  29.76 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  29.93 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  28.63 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  29.64 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  30.63 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2133  dihydrodipicolinate synthase  29.39 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6404  dihydrodipicolinate synthetase  29.51 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6235  dihydrodipicolinate synthetase  29.51 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6637  dihydrodipicolinate synthetase  29.51 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  28.35 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3398  dihydrodipicolinate synthetase  29.41 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  25.81 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  26.46 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4933  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3227  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.52 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  30.85 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  27.89 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  28.63 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  28.76 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  26.44 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  26.6 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  30.2 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1566  dihydrodipicolinate synthetase  28.2 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2942  dihydrodipicolinate synthetase  30.48 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.340616  normal  0.0534802 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6264  dihydrodipicolinate synthetase  28.2 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6740  dihydrodipicolinate synthetase  28.2 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  26.85 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  26.64 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  28.01 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  35.4 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  35.4 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  35.4 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5216  dihydrodipicolinate synthetase  27.69 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  35.4 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  35.4 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  35.4 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  27.69 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  35.4 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  27.95 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  27.52 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  27.05 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  25.1 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4586  dihydrodipicolinate synthetase  27.36 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  28.34 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4375  dihydrodipicolinate synthetase  28.76 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  29.96 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  24.66 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>