More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3377 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
311 aa  633  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4933  dihydrodipicolinate synthetase  76.24 
 
 
307 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3227  dihydrodipicolinate synthetase  76.24 
 
 
307 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2683  dihydrodipicolinate synthetase  72.7 
 
 
308 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6740  dihydrodipicolinate synthetase  74.92 
 
 
307 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1566  dihydrodipicolinate synthetase  74.92 
 
 
307 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6264  dihydrodipicolinate synthetase  74.92 
 
 
307 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5282  dihydrodipicolinate synthetase  73.6 
 
 
309 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3161  dihydrodipicolinate synthetase  71.8 
 
 
315 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0466092 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02728  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00110)  72.96 
 
 
309 aa  449  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.753115  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0071  dihydrodipicolinate synthase  70.16 
 
 
315 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02600  dihydrodipicolinate synthase DapA, putative  71.01 
 
 
383 aa  443  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0601  dihydrodipicolinate synthetase  74.59 
 
 
308 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3437  dihydrodipicolinate synthetase  35.74 
 
 
310 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0930984  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3342  dihydrodipicolinate synthetase  38.76 
 
 
312 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0058629  normal  0.508652 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0631  dihydrodipicolinate synthetase  32.9 
 
 
314 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000301226  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1167  putative dihydrodipicolinate synthetase  35.11 
 
 
314 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5676  dihydrodipicolinate synthetase  37.46 
 
 
312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1393  dihydrodipicolinate synthetase  37.81 
 
 
312 aa  162  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  32.67 
 
 
290 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  32.8 
 
 
300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  32.8 
 
 
300 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  32.8 
 
 
300 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  32.8 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  32.8 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  32.8 
 
 
301 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  32.8 
 
 
300 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  30.99 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  32.15 
 
 
301 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 
296 aa  109  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 
298 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1603  dihydrodipicolinate synthetase  28.38 
 
 
337 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  30.52 
 
 
298 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
290 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  30.27 
 
 
296 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 
294 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  32.69 
 
 
308 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 
294 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
292 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 
294 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
293 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 
298 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 
298 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
292 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
292 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 
302 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
292 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
292 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
292 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
292 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
292 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
292 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
297 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 
293 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  30.98 
 
 
297 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
292 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2144  dihydrodipicolinate synthase  32.38 
 
 
327 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00221445  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 
314 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  28.24 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  31.67 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 
294 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  28.8 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  32.56 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  29.57 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 
321 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 
296 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  26.73 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  29.96 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  28.34 
 
 
291 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 
294 aa  94  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  29.93 
 
 
310 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  32.79 
 
 
300 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  28.8 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  27.96 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  28.71 
 
 
293 aa  92.8  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6215  dihydrodipicolinate synthetase  30.34 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 
296 aa  92.4  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
292 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  27.03 
 
 
292 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0929  dihydrodipicolinate synthetase  29.35 
 
 
315 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.626944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  28.16 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6384  dihydrodipicolinate synthetase  30 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6617  dihydrodipicolinate synthetase  30 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.242372 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  25.08 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>