More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3300 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 312 aa  623  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  82.52 
 
 		 309 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  72.31 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  70.42 
 
 		 317 aa  464  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  74.52 
 
 		 311 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  74.11 
 
 		 308 aa  461  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  72.08 
 
 		 308 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  70.74 
 
 		 317 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  72.96 
 
 		 317 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3385  dihydrodipicolinate synthetase  68.49 
 
 		 317 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  61.33 
 
 		 310 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  60.33 
 
 		 310 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  52.98 
 
 		 311 aa  316  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1485  dihydrodipicolinate synthetase  56.46 
 
 		 302 aa  311  9e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.177737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  51.01 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  50.67 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  53.77 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  51.54 
 
 		 307 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  42.96 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  32.28 
 
 		 312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  32.21 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  31.35 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  28.91 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  31.49 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  31.25 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  29.53 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  29.57 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  29.61 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  29.61 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  28.87 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  30.07 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  29.93 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3308  dihydrodipicolinate synthetase  33.91 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  32.65 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  31.21 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  27.95 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1078  dihydrodipicolinate synthetase  34.49 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  31.35 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  30.56 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  32.14 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  31.83 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  32.23 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  26.92 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  29.41 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  32.56 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4375  dihydrodipicolinate synthetase  32.01 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  32.21 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  32.55 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5056  dihydrodipicolinate synthetase  31.68 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5804  dihydrodipicolinate synthetase  31.68 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3593  dihydrodipicolinate synthetase  27.59 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2133  dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3057  dihydrodipicolinate synthetase  31.49 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6235  dihydrodipicolinate synthetase  30.98 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5216  dihydrodipicolinate synthetase  29.61 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6404  dihydrodipicolinate synthetase  30.98 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3210  dihydrodipicolinate synthetase  31.14 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  29.61 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6637  dihydrodipicolinate synthetase  30.98 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5070  dihydrodipicolinate synthetase  31.14 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  32.43 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  32.43 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4586  dihydrodipicolinate synthetase  29.28 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3398  dihydrodipicolinate synthetase  30.98 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3940  dihydrodipicolinate synthetase  30.51 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  34.32 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  29.45 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  26.67 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  29.96 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  28.12 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  26.47 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  27.7 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  26.17 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  31.42 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2738  dihydrodipicolinate synthetase  29.9 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200643  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  35.37 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  35.37 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.33 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  31.37 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  29.63 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  27.72 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  29.57 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.38 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  24.83 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  26.17 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  24.75 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  30.35 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  25.16 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2014  dihydrodipicolinate synthetase  30 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  27.1 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2942  dihydrodipicolinate synthetase  29.72 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.340616  normal  0.0534802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>