More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3541 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3541  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 303 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  26.51 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.231 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  31.2 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  28.42 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  29.88 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  27.24 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  29.83 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  27.64 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  31.82 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  24.63 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  26.01 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  28.67 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  25.68 
 
 		 295 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  25.68 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  27.27 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  28.28 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  25.34 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  29.05 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  26.94 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  26.22 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  31.15 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  27.03 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  30.17 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  30.17 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  27.53 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  26.78 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0556  dihydrodipicolinate synthetase  28.7 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  27.04 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  26.01 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  26.01 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  27.73 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  27.34 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  27.31 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1536  dihydrodipicolinate synthetase  27.87 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.619521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  26.05 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  27.52 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  25.7 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2133  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2975  dihydrodipicolinate synthetase  29.6 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.696514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3593  dihydrodipicolinate synthetase  29.31 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6692  dihydrodipicolinate synthetase  30.8 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  25.68 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  25.68 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  28.17 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  26.14 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6171  dihydrodipicolinate synthetase  29.41 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  26.84 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.92 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  28.69 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  28.63 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  26.94 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  28.51 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  27.46 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  26.13 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  29.29 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  26.94 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  27.54 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  28.93 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  25.47 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  27.01 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.4 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  26.72 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  26.51 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  27.49 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  26.18 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  25.32 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  26.37 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  26.41 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  27.13 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  24.89 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  27.01 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  27.01 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  27.08 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  27.46 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  27.42 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  24.89 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  24.89 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  29.53 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5216  dihydrodipicolinate synthetase  29.75 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  29.75 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  28.19 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  26.79 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  27.16 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  32.03 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  32.93 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  25.91 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>