More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2975 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2975  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 310 aa  606  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.696514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  31.75 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  31.74 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  25.83 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  27.91 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1536  dihydrodipicolinate synthetase  30.67 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.619521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  29.73 
 
 		 307 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3541  dihydrodipicolinate synthetase  30.49 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  31.19 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  31.19 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  24.58 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  24.58 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  25.2 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  32.17 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  24.83 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  24.66 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  24.58 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  24.8 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.86 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  27.96 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  26.91 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  27.15 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  28.39 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  27.95 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  26.58 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  27.57 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  26.92 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  26.16 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  27.56 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  27.56 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  27.56 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  27.56 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  27.56 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  30.23 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  28.63 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  31.03 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.21 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  27.83 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  26.71 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  30.41 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  27.69 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  27.06 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  25.58 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  30.34 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  30.34 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  30.34 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  30.34 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  30.34 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  30.34 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  30.34 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  30.34 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  25.25 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  25.78 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  26.6 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  26.36 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  27.42 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3593  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  29.96 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  26.45 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  26.58 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  26.33 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  27.27 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  27.04 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  26.22 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  27.52 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  26.04 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  27.52 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  27.52 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  26.99 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4403  dihydrodipicolinate synthetase  29.17 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  26.82 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>