More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1341 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 605 aa  1203    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  44.01 
 
 		 581 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  40.32 
 
 		 714 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  42.46 
 
 		 607 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  40.29 
 
 		 670 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  44.59 
 
 		 584 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  41.93 
 
 		 606 aa  402  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  43.73 
 
 		 680 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  41.49 
 
 		 603 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  39.71 
 
 		 684 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  41.87 
 
 		 564 aa  382  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  41.93 
 
 		 632 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  37.39 
 
 		 620 aa  360  4e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  48.75 
 
 		 674 aa  344  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  39.97 
 
 		 640 aa  344  2.9999999999999997e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  38.94 
 
 		 661 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  39.45 
 
 		 666 aa  337  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  40.98 
 
 		 547 aa  335  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  41.7 
 
 		 538 aa  331  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  37.67 
 
 		 653 aa  325  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  48.11 
 
 		 566 aa  322  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  43.78 
 
 		 573 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  44.2 
 
 		 585 aa  322  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  46.7 
 
 		 635 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  55.9 
 
 		 599 aa  312  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  55.38 
 
 		 617 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  48.11 
 
 		 550 aa  302  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  36.08 
 
 		 585 aa  294  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  54.12 
 
 		 598 aa  286  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  54.12 
 
 		 598 aa  286  9e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  54.12 
 
 		 598 aa  286  9e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  52.05 
 
 		 649 aa  276  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  41.6 
 
 		 620 aa  274  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  44.85 
 
 		 496 aa  233  6e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  29.5 
 
 		 989 aa  179  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  35.34 
 
 		 900 aa  168  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  39.37 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  34.6 
 
 		 406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  34.85 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  27.93 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  36.69 
 
 		 855 aa  163  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  36.13 
 
 		 532 aa  161  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  34.23 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  36.5 
 
 		 533 aa  160  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  37.92 
 
 		 622 aa  160  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.09 
 
 		 849 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.23 
 
 		 848 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.72 
 
 		 856 aa  159  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  35.17 
 
 		 403 aa  159  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  35.4 
 
 		 410 aa  158  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  36.06 
 
 		 534 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  36.13 
 
 		 533 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  36.3 
 
 		 533 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  37.69 
 
 		 532 aa  157  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  37.41 
 
 		 532 aa  157  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.69 
 
 		 990 aa  157  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  28.57 
 
 		 619 aa  156  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.26 
 
 		 839 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  37 
 
 		 533 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  32.81 
 
 		 594 aa  154  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  33.45 
 
 		 537 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  33.09 
 
 		 1029 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.53 
 
 		 853 aa  153  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  34.89 
 
 		 594 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  34.89 
 
 		 594 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  38.84 
 
 		 977 aa  153  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  35.64 
 
 		 533 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  35.27 
 
 		 530 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  35.21 
 
 		 495 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  29.36 
 
 		 624 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  36.02 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  33.11 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  35.11 
 
 		 531 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  34.09 
 
 		 487 aa  152  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  36.36 
 
 		 532 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  32.56 
 
 		 462 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  35.17 
 
 		 533 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  31.6 
 
 		 416 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  35.23 
 
 		 495 aa  150  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  36.72 
 
 		 533 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  35.56 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  34.04 
 
 		 486 aa  150  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  34.31 
 
 		 531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  37.25 
 
 		 605 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  36.47 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  34.05 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.04 
 
 		 856 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  35.9 
 
 		 595 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  33.68 
 
 		 489 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.55 
 
 		 995 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  37.59 
 
 		 534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  34.8 
 
 		 525 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  35.51 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  28 
 
 		 638 aa  148  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  32.6 
 
 		 419 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  32.6 
 
 		 419 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  32.38 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  35.36 
 
 		 470 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  35.36 
 
 		 470 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 487 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>