More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0535 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
596 aa  1190    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 
927 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.71 
 
 
1694 aa  110  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
543 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
602 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 
1276 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 
466 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  34.66 
 
 
560 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.6 
 
 
1979 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.7 
 
 
784 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 
878 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 
466 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.03 
 
 
810 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.24 
 
 
707 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 
523 aa  98.2  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
3035 aa  98.2  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
711 aa  97.1  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.82 
 
 
397 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
740 aa  96.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
761 aa  96.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 
562 aa  95.9  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
435 aa  95.1  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
955 aa  94.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
3560 aa  94  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29 
 
 
836 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
512 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  32.12 
 
 
1007 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 
4489 aa  92.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
471 aa  92.8  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
1297 aa  91.7  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
523 aa  90.9  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
1192 aa  90.9  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 
344 aa  90.5  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
1827 aa  90.5  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 
247 aa  90.5  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 
685 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 
4079 aa  89.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.99 
 
 
784 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.14 
 
 
576 aa  88.6  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  32.96 
 
 
573 aa  88.6  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
250 aa  89  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 
833 aa  88.2  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
465 aa  87.4  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28 
 
 
1022 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.9 
 
 
417 aa  87  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
329 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
1094 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
699 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.55 
 
 
818 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
716 aa  85.5  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
649 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.74 
 
 
632 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.16 
 
 
1056 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
280 aa  84  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.23 
 
 
745 aa  84  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.65 
 
 
743 aa  84  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.55 
 
 
730 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.79 
 
 
635 aa  83.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 
564 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  25.75 
 
 
706 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
732 aa  82.4  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
713 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
213 aa  82  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 
608 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.86 
 
 
1138 aa  81.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
681 aa  80.9  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.57 
 
 
816 aa  80.9  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
739 aa  80.9  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.16 
 
 
465 aa  80.9  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  28.19 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  27.35 
 
 
1056 aa  80.5  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
361 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
617 aa  79.7  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27.54 
 
 
623 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
662 aa  79.7  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
254 aa  79  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
1276 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.88 
 
 
725 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.86 
 
 
465 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
602 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.5 
 
 
1676 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  27.91 
 
 
936 aa  78.2  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
909 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
591 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.07 
 
 
988 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  28.26 
 
 
545 aa  77  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.08 
 
 
820 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
279 aa  76.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
589 aa  76.6  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
409 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
301 aa  76.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.5 
 
 
689 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  28.26 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  29.85 
 
 
715 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>