More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0411 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 290 aa  579  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  51.7 
 
 		 297 aa  281  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3575  diaminopimelate epimerase  53.61 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  52.56 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  51.89 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  53.29 
 
 		 290 aa  268  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0372  diaminopimelate epimerase  51.37 
 
 		 289 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0251  diaminopimelate epimerase  51.92 
 
 		 293 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0514  diaminopimelate epimerase  51.38 
 
 		 293 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.2458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1859  diaminopimelate epimerase  53.41 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1932  diaminopimelate epimerase  53.41 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0359  diaminopimelate epimerase  51.38 
 
 		 293 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3391  diaminopimelate epimerase  50.71 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3748  diaminopimelate epimerase  48.94 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3093  diaminopimelate epimerase  50.36 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4071  diaminopimelate epimerase  48.94 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0183  diaminopimelate epimerase  51.68 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  51.25 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3656  diaminopimelate epimerase  52.51 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0381626  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0927  diaminopimelate epimerase  51.59 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2947  Diaminopimelate epimerase  49.32 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2720  diaminopimelate epimerase  49.83 
 
 		 296 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.991154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  45.99 
 
 		 281 aa  226  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  48.6 
 
 		 293 aa  225  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  47.52 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2842  Diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0231315  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4198  diaminopimelate epimerase  46.37 
 
 		 303 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  46.57 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  45.42 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  48.18 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  45.36 
 
 		 282 aa  209  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0019  diaminopimelate epimerase  44.69 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4868  diaminopimelate epimerase  46.02 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  47.96 
 
 		 275 aa  202  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  42.24 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 275 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  46.3 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  46.55 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  46.91 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  44.85 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  39.57 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  39.35 
 
 		 279 aa  192  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  40.94 
 
 		 281 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  39.57 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 280 aa  185  9e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  39.21 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  36.47 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  40.07 
 
 		 334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  46.64 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  43.01 
 
 		 276 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  38.11 
 
 		 407 aa  181  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  40.86 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  39.72 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  41.73 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0019  diaminopimelate epimerase  45.52 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 280 aa  175  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  36.2 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  37.87 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  39.34 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  38.55 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000531715  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  38.55 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  35.51 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  38.97 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  38.97 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  37.06 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  38.75 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  37.72 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  39.34 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  37.72 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0183  diaminopimelate epimerase  40.81 
 
 		 276 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  41.18 
 
 		 276 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5499  diaminopimelate epimerase  41.97 
 
 		 276 aa  168  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  37.13 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  37.64 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0125  diaminopimelate epimerase  33.82 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  41.97 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  35.92 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  38.01 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  34.42 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  37.64 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  37.13 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  35.32 
 
 		 269 aa  165  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002111  diaminopimelate epimerase  38.97 
 
 		 276 aa  165  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  37.27 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  37.27 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  38.89 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>