More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5793 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  49.04 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  41.22 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 171 aa  99  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4468  transcriptional regulator, TrmB  36.42 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160154  normal  0.0294539 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  29.71 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  34.21 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  22.52 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 159 aa  62  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  25.75 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  29.91 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0020  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.965636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 153 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 151 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 149 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 159 aa  51.2  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  28.79 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  29.52 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.7 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  23.7 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  23.7 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03120  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.489584  hitchhiker  0.0000000819923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  29.52 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>