More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1994 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  47.11 
 
 		 850 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 837 aa  1605    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  45.19 
 
 		 849 aa  630  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  46.75 
 
 		 847 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  46.27 
 
 		 847 aa  612  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  48.47 
 
 		 839 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  47.15 
 
 		 866 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  46.45 
 
 		 870 aa  552  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  46.02 
 
 		 845 aa  534  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  40.42 
 
 		 855 aa  533  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  46.22 
 
 		 843 aa  514  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  47.12 
 
 		 843 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  29.95 
 
 		 858 aa  285  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  46.56 
 
 		 846 aa  282  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  30.86 
 
 		 858 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  33.7 
 
 		 841 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  29.15 
 
 		 851 aa  258  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 		 849 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  28.76 
 
 		 849 aa  248  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  30.82 
 
 		 846 aa  246  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 		 857 aa  244  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  26.99 
 
 		 817 aa  242  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.9 
 
 		 817 aa  240  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  25.82 
 
 		 817 aa  240  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  33.1 
 
 		 835 aa  238  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 		 835 aa  238  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  28.72 
 
 		 850 aa  234  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  27.43 
 
 		 855 aa  228  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  30.76 
 
 		 844 aa  226  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 842 aa  226  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  27.11 
 
 		 836 aa  221  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 		 842 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  28.28 
 
 		 889 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 		 842 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  28.49 
 
 		 879 aa  207  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  27.56 
 
 		 889 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  28.38 
 
 		 884 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.23 
 
 		 820 aa  206  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  29.47 
 
 		 819 aa  206  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  26.36 
 
 		 840 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  30.52 
 
 		 884 aa  203  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  28.2 
 
 		 857 aa  203  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  30.54 
 
 		 821 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  28.52 
 
 		 887 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  31.77 
 
 		 877 aa  196  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  27.47 
 
 		 897 aa  194  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  31.75 
 
 		 877 aa  194  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  28.56 
 
 		 887 aa  193  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  30.41 
 
 		 821 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  28.2 
 
 		 850 aa  187  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  29.35 
 
 		 821 aa  185  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  27.98 
 
 		 867 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  28.76 
 
 		 800 aa  183  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  23.77 
 
 		 865 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  29.27 
 
 		 853 aa  181  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  28.67 
 
 		 889 aa  181  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  30.57 
 
 		 821 aa  181  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  26.81 
 
 		 845 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  28.14 
 
 		 855 aa  178  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  26.77 
 
 		 878 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  29.69 
 
 		 866 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.51 
 
 		 855 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  28.48 
 
 		 804 aa  160  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  29.52 
 
 		 793 aa  157  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  28.67 
 
 		 819 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  26.1 
 
 		 849 aa  155  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  29.68 
 
 		 802 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  24.75 
 
 		 803 aa  142  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  26.56 
 
 		 841 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  32.4 
 
 		 820 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.77 
 
 		 854 aa  131  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  30 
 
 		 868 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  26 
 
 		 847 aa  125  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 		 408 aa  124  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  28.93 
 
 		 836 aa  123  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  30.03 
 
 		 836 aa  118  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  27.97 
 
 		 825 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.44 
 
 		 848 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  26.69 
 
 		 849 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  28.78 
 
 		 815 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 		 852 aa  108  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 		 861 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.03 
 
 		 836 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  28.71 
 
 		 753 aa  105  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  31.13 
 
 		 800 aa  105  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 855 aa  105  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  29.86 
 
 		 820 aa  104  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  33.99 
 
 		 445 aa  104  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 855 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  34.62 
 
 		 795 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  25.71 
 
 		 821 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  22.39 
 
 		 813 aa  100  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  28.34 
 
 		 872 aa  98.6  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  30.68 
 
 		 795 aa  98.2  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  25.86 
 
 		 849 aa  97.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  26.44 
 
 		 825 aa  96.3  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.29 
 
 		 843 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  25.16 
 
 		 873 aa  96.3  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  30.58 
 
 		 819 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 		 859 aa  95.5  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>