More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4191 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
982 aa  1858    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  42.11 
 
 
1287 aa  203  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  41.09 
 
 
2145 aa  180  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  51.3 
 
 
946 aa  172  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  48.74 
 
 
2954 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.3 
 
 
3427 aa  167  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  47.89 
 
 
2105 aa  163  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  50.65 
 
 
4334 aa  162  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  49.12 
 
 
1164 aa  159  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  45.85 
 
 
1895 aa  159  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  48.31 
 
 
1400 aa  157  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  48.28 
 
 
1424 aa  157  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.14 
 
 
1795 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.9 
 
 
2667 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  40.78 
 
 
491 aa  149  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.86 
 
 
1236 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  36.54 
 
 
1532 aa  148  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.27 
 
 
1279 aa  145  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.43 
 
 
980 aa  144  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  47.24 
 
 
613 aa  144  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  39.22 
 
 
393 aa  144  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.13 
 
 
1534 aa  144  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  39.36 
 
 
460 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  38.62 
 
 
615 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  44.23 
 
 
833 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.27 
 
 
1363 aa  141  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  44.13 
 
 
5171 aa  139  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.17 
 
 
2668 aa  140  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  43.28 
 
 
3954 aa  140  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  45.25 
 
 
595 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  48.66 
 
 
3619 aa  138  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  48.13 
 
 
3619 aa  138  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.36 
 
 
588 aa  137  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  43.37 
 
 
2775 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  50.68 
 
 
824 aa  137  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  41.57 
 
 
965 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  36.01 
 
 
9867 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  38.27 
 
 
526 aa  135  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  41.24 
 
 
4800 aa  134  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  48.62 
 
 
709 aa  134  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  36.7 
 
 
4687 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  39.86 
 
 
329 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  39.86 
 
 
329 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  40.73 
 
 
387 aa  130  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  39.25 
 
 
850 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  35.69 
 
 
460 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  27.85 
 
 
2689 aa  129  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  37.42 
 
 
3209 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.91 
 
 
2678 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  43.16 
 
 
950 aa  127  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  42.19 
 
 
363 aa  127  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  25.96 
 
 
4798 aa  127  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  43.48 
 
 
341 aa  126  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  36.86 
 
 
795 aa  126  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  37.5 
 
 
437 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  48.19 
 
 
813 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  36.64 
 
 
561 aa  125  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  47.24 
 
 
421 aa  125  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  45.88 
 
 
589 aa  124  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  44.5 
 
 
757 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  40.93 
 
 
341 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  36.77 
 
 
437 aa  122  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  52.47 
 
 
260 aa  121  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  48.88 
 
 
1544 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  41.08 
 
 
639 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  40.7 
 
 
387 aa  119  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  29.17 
 
 
1712 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  43.52 
 
 
1197 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  39.36 
 
 
1855 aa  118  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  41.74 
 
 
1079 aa  118  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  38.6 
 
 
1499 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.63 
 
 
1963 aa  117  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  36.3 
 
 
396 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  46.04 
 
 
355 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  43.2 
 
 
424 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  40.25 
 
 
1883 aa  115  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  47.1 
 
 
232 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  46.73 
 
 
280 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  27.93 
 
 
1884 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  39.37 
 
 
1043 aa  115  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  38.26 
 
 
2911 aa  115  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  49.2 
 
 
3608 aa  115  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  43.68 
 
 
2885 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  38.08 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  46.23 
 
 
280 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  36.27 
 
 
357 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  36.05 
 
 
518 aa  112  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 
741 aa  112  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  36.4 
 
 
734 aa  112  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  44.81 
 
 
679 aa  111  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  44.19 
 
 
243 aa  111  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.33 
 
 
1016 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  41.46 
 
 
327 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  46.34 
 
 
585 aa  110  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  43.78 
 
 
385 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  38.29 
 
 
1383 aa  110  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  47.95 
 
 
686 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  44.72 
 
 
1055 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  46.75 
 
 
686 aa  109  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  33.64 
 
 
820 aa  107  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>