More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0878 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  54.23 
 
 		 811 aa  670    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  55 
 
 		 824 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  55.8 
 
 		 776 aa  704    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  55.74 
 
 		 755 aa  716    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  55.17 
 
 		 824 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 626 aa  1277    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  52.18 
 
 		 712 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  47.22 
 
 		 658 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  47.22 
 
 		 680 aa  525  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  45.94 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  43.75 
 
 		 602 aa  485  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  39.15 
 
 		 739 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  38.31 
 
 		 646 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  39.9 
 
 		 775 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  39.08 
 
 		 734 aa  399  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  40.65 
 
 		 761 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  39.44 
 
 		 770 aa  392  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  40.07 
 
 		 714 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  39.19 
 
 		 714 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  39.82 
 
 		 779 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  38.49 
 
 		 734 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  42.36 
 
 		 750 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  39.02 
 
 		 735 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  39.86 
 
 		 723 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  39.66 
 
 		 833 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  39.82 
 
 		 776 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  37.57 
 
 		 741 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  39.5 
 
 		 720 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  39.53 
 
 		 728 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  37.79 
 
 		 732 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  40.42 
 
 		 750 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  38.49 
 
 		 691 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  38.92 
 
 		 712 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  38.33 
 
 		 727 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  38.33 
 
 		 727 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  38.7 
 
 		 643 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  40.82 
 
 		 751 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  37.21 
 
 		 720 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  38.8 
 
 		 643 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  38.8 
 
 		 643 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  38.1 
 
 		 728 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0021  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  41.59 
 
 		 762 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  40.82 
 
 		 751 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37.61 
 
 		 618 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  40.22 
 
 		 757 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  40.82 
 
 		 683 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  39.97 
 
 		 656 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  38.42 
 
 		 763 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  38.08 
 
 		 806 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  38.6 
 
 		 730 aa  369  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  39.61 
 
 		 651 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  40.07 
 
 		 658 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  37.67 
 
 		 654 aa  366  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  41.51 
 
 		 751 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  38.24 
 
 		 625 aa  365  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  37.05 
 
 		 712 aa  365  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 		 718 aa  363  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  39.15 
 
 		 640 aa  362  8e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  38.32 
 
 		 761 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  39.79 
 
 		 681 aa  361  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  38.48 
 
 		 669 aa  359  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  39.35 
 
 		 649 aa  358  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  37.01 
 
 		 751 aa  357  5e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.48 
 
 		 640 aa  357  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  36.77 
 
 		 648 aa  356  6.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  38.92 
 
 		 661 aa  356  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  38.45 
 
 		 626 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2473  glycosyl transferase/transpeptidase  37.06 
 
 		 756 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  37.16 
 
 		 724 aa  352  8.999999999999999e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  38.48 
 
 		 763 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2326  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  39.04 
 
 		 757 aa  352  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  37.16 
 
 		 759 aa  352  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  39.58 
 
 		 905 aa  351  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  37.21 
 
 		 724 aa  350  6e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  37.02 
 
 		 718 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  37.5 
 
 		 759 aa  348  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  36.48 
 
 		 768 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  36.98 
 
 		 714 aa  348  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  37.3 
 
 		 693 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0426  putative penicillin binding protein  35.74 
 
 		 589 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  38.75 
 
 		 796 aa  347  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  37.01 
 
 		 760 aa  347  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.32 
 
 		 727 aa  346  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  36.85 
 
 		 679 aa  346  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  38.85 
 
 		 683 aa  345  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  37.83 
 
 		 740 aa  344  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  37.54 
 
 		 683 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  39.35 
 
 		 709 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  38.25 
 
 		 709 aa  343  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36.23 
 
 		 727 aa  343  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04511  putative penicillin binding protein  35.83 
 
 		 589 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.534356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  37.37 
 
 		 683 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  34.9 
 
 		 742 aa  342  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  36.08 
 
 		 760 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  37.19 
 
 		 683 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  37.19 
 
 		 683 aa  342  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  37.19 
 
 		 683 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  36.3 
 
 		 784 aa  340  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  37.35 
 
 		 662 aa  340  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  36.3 
 
 		 765 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>