285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0039 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  100 
 
 
451 aa  901  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  54.46 
 
 
394 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  50.7 
 
 
395 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  35.03 
 
 
385 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  34.97 
 
 
368 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  32.24 
 
 
388 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0074  hypothetical protein  67.02 
 
 
117 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532123  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  29.24 
 
 
397 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  30.48 
 
 
370 aa  120  5e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.81 
 
 
365 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  42.05 
 
 
387 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  40.1 
 
 
373 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  29.5 
 
 
402 aa  110  4e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  39.02 
 
 
375 aa  107  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.14455e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  26.47 
 
 
424 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.1 
 
 
377 aa  103  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  36.9 
 
 
379 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  27.9 
 
 
390 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.88 
 
 
369 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  24.6 
 
 
404 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.56 
 
 
369 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  25.73 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  22.45 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  29.62 
 
 
399 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  28.69 
 
 
367 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.14 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  32.18 
 
 
323 aa  88.2  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  28.65 
 
 
373 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.58 
 
 
363 aa  85.9  1e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  24.21 
 
 
433 aa  84  6e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.8 
 
 
376 aa  83.2  8e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2351  integrase family protein  34.59 
 
 
427 aa  83.2  9e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  21.18 
 
 
376 aa  82.8  1e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.61 
 
 
325 aa  82.8  1e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  20.45 
 
 
381 aa  82.8  1e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.31 
 
 
414 aa  82.4  2e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.22 
 
 
377 aa  81.6  2e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  26.5 
 
 
378 aa  82.4  2e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  31.79 
 
 
378 aa  81.6  3e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  23.58 
 
 
399 aa  80.9  4e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  22.28 
 
 
383 aa  80.9  5e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.32895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  33.83 
 
 
391 aa  80.5  6e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  22.58 
 
 
370 aa  79.3  1e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25 
 
 
380 aa  79.3  1e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  25.88 
 
 
422 aa  79  1e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.81 
 
 
390 aa  79.3  1e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  32.56 
 
 
396 aa  79.3  1e-13  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  26.22 
 
 
422 aa  78.6  2e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  20.79 
 
 
376 aa  78.6  2e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  32.76 
 
 
357 aa  78.2  3e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  22.27 
 
 
389 aa  78.2  3e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  28.27 
 
 
371 aa  78.2  3e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1795  Integrase  33.33 
 
 
407 aa  77.8  4e-13  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.24 
 
 
381 aa  77.8  4e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.65595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  20.59 
 
 
381 aa  77.4  5e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.4 
 
 
386 aa  76.6  7e-13  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  25.6 
 
 
401 aa  76.3  1e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  35.9 
 
 
407 aa  74.7  3e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  27.12 
 
 
391 aa  73.9  5e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  24.24 
 
 
395 aa  73.9  5e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  24.31 
 
 
398 aa  73.9  6e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  26.42 
 
 
402 aa  73.6  6e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  31.89 
 
 
368 aa  72.8  1e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  23.04 
 
 
391 aa  72.8  1e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  25.54 
 
 
407 aa  72.4  2e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  33.33 
 
 
198 aa  72  2e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  23.47 
 
 
392 aa  72  2e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.97895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.43 
 
 
369 aa  71.6  3e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  1.20563e-05 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.67 
 
 
368 aa  71.2  3e-11  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  27.64 
 
 
381 aa  70.9  5e-11  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.14 
 
 
370 aa  70.5  7e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  20.6 
 
 
374 aa  70.5  7e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  22.8 
 
 
385 aa  69.3  1e-10  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.19227e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  21.2 
 
 
378 aa  69.3  1e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  23.61 
 
 
370 aa  69.3  1e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  23.17 
 
 
361 aa  68.6  2e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  31.82 
 
 
402 aa  68.9  2e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  25.71 
 
 
209 aa  68.6  2e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.69 
 
 
376 aa  67.8  3e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  22.88 
 
 
400 aa  68.2  3e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.69 
 
 
376 aa  67.8  3e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.1 
 
 
477 aa  68.2  3e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  30.52 
 
 
416 aa  68.2  3e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  23.38 
 
 
376 aa  66.6  9e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.13824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  22.74 
 
 
356 aa  65.9  1e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.65 
 
 
379 aa  66.2  1e-09  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  24.21 
 
 
357 aa  65.1  2e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.7 
 
 
435 aa  65.1  3e-09  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.12 
 
 
451 aa  64.3  4e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  23.9 
 
 
498 aa  63.5  7e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.12 
 
 
378 aa  62.4  1e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  20.87 
 
 
398 aa  62.8  1e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  27.71 
 
 
423 aa  62.8  1e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.885e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.89 
 
 
393 aa  63.2  1e-08  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  26.21 
 
 
387 aa  62.4  2e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  21.69 
 
 
373 aa  61.6  3e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25 
 
 
383 aa  61.6  3e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.24 
 
 
385 aa  61.6  3e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.73 
 
 
386 aa  61.2  4e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  30.24 
 
 
442 aa  61.2  4e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>