222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0099 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 651 aa  1334    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 701 aa  132  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 644 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 		 345 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  27.49 
 
 		 619 aa  113  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 691 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 690 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 663 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  28.28 
 
 		 679 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  26.98 
 
 		 701 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  26.02 
 
 		 595 aa  109  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 647 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  27.33 
 
 		 658 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  28.68 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  25.23 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 681 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 687 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 587 aa  103  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 650 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 690 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  27.88 
 
 		 646 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 693 aa  102  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  25.91 
 
 		 346 aa  99.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.45 
 
 		 692 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 692 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  26.43 
 
 		 579 aa  97.4  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 612 aa  97.4  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 693 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  32.37 
 
 		 373 aa  95.5  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  27.93 
 
 		 344 aa  95.1  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  30.99 
 
 		 339 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 336 aa  93.2  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  24.93 
 
 		 334 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 		 333 aa  91.3  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 522 aa  91.3  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  24.28 
 
 		 572 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  34.21 
 
 		 611 aa  90.5  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 334 aa  89.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1251  batB protein, putative  26.85 
 
 		 322 aa  89.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.711324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  24.43 
 
 		 572 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  27.67 
 
 		 577 aa  88.6  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  28.4 
 
 		 331 aa  87.8  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 664 aa  87.8  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  26.1 
 
 		 531 aa  87.4  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  26.24 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  26.04 
 
 		 599 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 657 aa  85.5  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 653 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  31.03 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 571 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  27.93 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  26.29 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  32.18 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  26.84 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  24.7 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  22.57 
 
 		 572 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  25.93 
 
 		 578 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  26.92 
 
 		 344 aa  79.7  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  23.31 
 
 		 601 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.24 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 572 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 		 336 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  25.4 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  24.58 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  26.57 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  30.04 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  24.49 
 
 		 690 aa  77.8  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 612 aa  77.8  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  22.75 
 
 		 351 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  27.03 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  23.95 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  26.84 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  27.84 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  28.22 
 
 		 330 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  24.52 
 
 		 340 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 		 589 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  21.46 
 
 		 503 aa  73.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.25 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  24.58 
 
 		 576 aa  72  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  29.25 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  29.46 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  25.54 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  28.01 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  25.36 
 
 		 333 aa  69.7  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 		 325 aa  70.1  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 340 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 		 342 aa  70.5  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 339 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 339 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  26.38 
 
 		 325 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  36.97 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  28.29 
 
 		 754 aa  69.3  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.13 
 
 		 327 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  27.82 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  28.46 
 
 		 339 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 588 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>