279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0047 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0047  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
788 aa  1595  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.210348  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
451 aa  180  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 
923 aa  170  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
780 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
3145 aa  150  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.75 
 
 
689 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
1005 aa  143  2e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.49 
 
 
614 aa  141  4e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.49 
 
 
614 aa  141  4e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
614 aa  141  4e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.49 
 
 
626 aa  141  4e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 
614 aa  141  4e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.35 
 
 
626 aa  140  8e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.75 
 
 
1034 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
607 aa  139  3e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
614 aa  137  6e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 
558 aa  137  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.96 
 
 
626 aa  136  2e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
472 aa  135  2e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 
1450 aa  136  2e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
608 aa  134  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  29.01 
 
 
872 aa  132  2e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 
556 aa  132  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
1827 aa  131  5e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 
662 aa  131  5e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
740 aa  130  1e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
611 aa  129  1e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.63 
 
 
760 aa  130  1e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  30.33 
 
 
703 aa  129  2e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
688 aa  129  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
542 aa  129  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
620 aa  127  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
767 aa  127  8e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
502 aa  127  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 
502 aa  127  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
484 aa  127  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
502 aa  127  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.1 
 
 
620 aa  126  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
595 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
412 aa  125  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  27.94 
 
 
600 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
496 aa  124  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
457 aa  123  1e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
523 aa  122  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
545 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.23 
 
 
1764 aa  122  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
1038 aa  121  4e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  30.63 
 
 
473 aa  121  5e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
1212 aa  121  5e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  27.55 
 
 
1677 aa  119  2e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
747 aa  119  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
578 aa  119  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 
545 aa  118  4e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  27.96 
 
 
577 aa  118  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
546 aa  118  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
592 aa  118  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.04 
 
 
646 aa  117  7e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 
550 aa  117  7e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
545 aa  117  9e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
714 aa  116  1e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
588 aa  116  1e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
573 aa  117  1e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
955 aa  115  2e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  28.09 
 
 
540 aa  115  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
602 aa  114  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.4 
 
 
733 aa  114  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  27.44 
 
 
648 aa  113  1e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
574 aa  113  2e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
649 aa  112  2e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
649 aa  112  2e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 
615 aa  111  4e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
639 aa  111  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 
601 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
438 aa  109  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
612 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
505 aa  109  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
636 aa  108  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
559 aa  108  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  28.19 
 
 
714 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
520 aa  107  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2052  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
584 aa  107  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  27.86 
 
 
705 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1567  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
509 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.085115  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1279  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
584 aa  106  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1592  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
509 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0865529  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
571 aa  106  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
595 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.8 
 
 
545 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
527 aa  105  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  30.02 
 
 
509 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  30.02 
 
 
509 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  30.02 
 
 
509 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 
509 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  24.34 
 
 
1077 aa  104  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  28.14 
 
 
711 aa  104  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1752  TPR domain-containing protein  30.02 
 
 
509 aa  104  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
593 aa  104  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
935 aa  104  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  28.14 
 
 
598 aa  104  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 
454 aa  104  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>