More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0702 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  77 
 
 		 853 aa  1337    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 948 aa  1909    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  57.36 
 
 		 870 aa  932    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  37.72 
 
 		 803 aa  527  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 843 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  37.66 
 
 		 797 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  37.18 
 
 		 817 aa  524  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  37.78 
 
 		 797 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 797 aa  522  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  37.54 
 
 		 797 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 812 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 812 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  37.28 
 
 		 812 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  38.43 
 
 		 797 aa  505  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  36.34 
 
 		 853 aa  487  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 847 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 933 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  34.99 
 
 		 817 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  36.49 
 
 		 848 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  35.48 
 
 		 784 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 		 918 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 874 aa  436  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 795 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  35.25 
 
 		 795 aa  428  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  33.06 
 
 		 788 aa  419  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 887 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 793 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 788 aa  416  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 924 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 803 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  32.79 
 
 		 793 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 795 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  33.2 
 
 		 948 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.16 
 
 		 811 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  33.22 
 
 		 864 aa  403  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.12 
 
 		 1015 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 811 aa  399  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.67 
 
 		 800 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 800 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  32.55 
 
 		 840 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 924 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.94 
 
 		 856 aa  379  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 851 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 947 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 868 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 857 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.53 
 
 		 867 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.41 
 
 		 799 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 871 aa  366  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 867 aa  366  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 858 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 867 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  30.15 
 
 		 961 aa  361  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 877 aa  360  7e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 861 aa  360  9e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 869 aa  355  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 870 aa  347  6e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  29.13 
 
 		 884 aa  343  9e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 815 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 883 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 835 aa  327  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  29.81 
 
 		 821 aa  323  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 850 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 804 aa  317  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 815 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 811 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.92 
 
 		 832 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 818 aa  308  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 833 aa  307  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 987 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  29.61 
 
 		 823 aa  305  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 800 aa  304  5.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 872 aa  300  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 842 aa  291  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 847 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 849 aa  261  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 816 aa  254  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 885 aa  240  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 858 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 842 aa  232  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 813 aa  221  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 852 aa  208  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 873 aa  201  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 855 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 861 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 861 aa  183  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 861 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 861 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 871 aa  170  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 861 aa  170  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 841 aa  169  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 861 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.93 
 
 		 839 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 853 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 838 aa  164  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 843 aa  157  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  26.87 
 
 		 853 aa  156  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 904 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 817 aa  154  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 879 aa  152  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>