More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2621 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 871 aa  1741    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 843 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  36.27 
 
 		 784 aa  432  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 811 aa  426  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 835 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  36.14 
 
 		 795 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 788 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  34.44 
 
 		 788 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 817 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 803 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 797 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 797 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 853 aa  398  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 797 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 797 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 812 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 795 aa  395  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  33.59 
 
 		 840 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 812 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 812 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 933 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  32.54 
 
 		 821 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 803 aa  389  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  34.49 
 
 		 887 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 811 aa  383  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 815 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 842 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  33.41 
 
 		 847 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  32.55 
 
 		 948 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 924 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  33.72 
 
 		 848 aa  372  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.21 
 
 		 800 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 795 aa  369  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 918 aa  366  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  32.98 
 
 		 884 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.17 
 
 		 832 aa  365  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 800 aa  364  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.33 
 
 		 799 aa  364  5.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 948 aa  363  8e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.35 
 
 		 811 aa  362  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 883 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  31.01 
 
 		 797 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 853 aa  355  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  31.89 
 
 		 793 aa  347  5e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 804 aa  347  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 793 aa  347  6e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 817 aa  343  5.999999999999999e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 874 aa  342  1e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  31.16 
 
 		 961 aa  342  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  32.92 
 
 		 823 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 868 aa  340  7e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 		 818 aa  334  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 849 aa  331  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 847 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  30.85 
 
 		 870 aa  322  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 800 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 947 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 850 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 867 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 858 aa  313  9e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 861 aa  313  9e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  29.7 
 
 		 864 aa  313  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 867 aa  311  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 987 aa  310  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 924 aa  310  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 842 aa  303  8.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 852 aa  303  9e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 815 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 885 aa  301  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 833 aa  300  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 851 aa  295  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.19 
 
 		 1015 aa  293  8e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 869 aa  287  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 872 aa  285  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 816 aa  276  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 858 aa  273  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 873 aa  269  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 813 aa  269  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 879 aa  229  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 857 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.87 
 
 		 856 aa  197  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 877 aa  191  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.56 
 
 		 867 aa  183  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 870 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 841 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  26.2 
 
 		 853 aa  140  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 853 aa  139  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.93 
 
 		 839 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 853 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 853 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 853 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 843 aa  135  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 866 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 879 aa  129  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 838 aa  128  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 873 aa  119  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  23.37 
 
 		 895 aa  118  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 873 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  23.23 
 
 		 893 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 924 aa  115  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>