166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0582 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  81.4 
 
 		 473 aa  772    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  82.24 
 
 		 489 aa  760    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  82.45 
 
 		 489 aa  763    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  82.45 
 
 		 489 aa  766    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  83.65 
 
 		 493 aa  779    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 464 aa  944    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  83.72 
 
 		 489 aa  775    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  83.93 
 
 		 489 aa  777    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  71.52 
 
 		 465 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  83.93 
 
 		 473 aa  777    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  67.16 
 
 		 473 aa  631  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  67.69 
 
 		 477 aa  622  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  67.17 
 
 		 467 aa  623  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  69.48 
 
 		 463 aa  620  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  62.3 
 
 		 517 aa  559  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  43.26 
 
 		 473 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  42.7 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  43.37 
 
 		 466 aa  346  4e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  42.59 
 
 		 463 aa  342  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  41.24 
 
 		 476 aa  341  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  41.94 
 
 		 471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 452 aa  166  9e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 470 aa  158  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4572  outer membrane efflux protein  31.18 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  29.91 
 
 		 457 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0654  outer membrane efflux protein  28.03 
 
 		 587 aa  150  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1040  outer membrane efflux protein  29.92 
 
 		 583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  27.39 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 471 aa  91.3  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  20.86 
 
 		 488 aa  90.5  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 503 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  20.67 
 
 		 458 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.14 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  26.03 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  26.74 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 627 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  21.68 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  26.29 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  20.22 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  20.04 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  23.85 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  23.51 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  21.5 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.14 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  21.35 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.28 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  21.76 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.09 
 
 		 420 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 447 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 635 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 1496 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  21.25 
 
 		 435 aa  54.7  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  19.72 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1470 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  20.87 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  26.99 
 
 		 523 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.86 
 
 		 497 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 		 456 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.37 
 
 		 483 aa  53.5  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.86 
 
 		 486 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0056  porin (omp) ABC transporter protein  29.29 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  28.89 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.61 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  28.06 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 462 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  20.84 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  25.63 
 
 		 451 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  24.86 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>