117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0733 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  88.86 
 
 		 356 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  100 
 
 		 359 aa  711    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  84.76 
 
 		 353 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  82.73 
 
 		 346 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  78.78 
 
 		 369 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  79.56 
 
 		 354 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  79.56 
 
 		 354 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  76.68 
 
 		 365 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  68.8 
 
 		 348 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  66.49 
 
 		 361 aa  484  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  66.03 
 
 		 342 aa  475  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  65.37 
 
 		 342 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  65.58 
 
 		 353 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  60.28 
 
 		 342 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  63.91 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  62.57 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  53.66 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  50.14 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  52.3 
 
 		 354 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  52.43 
 
 		 354 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  51.63 
 
 		 354 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  52.03 
 
 		 354 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  51.08 
 
 		 352 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  52.6 
 
 		 347 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  52.6 
 
 		 372 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  49.05 
 
 		 354 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  48.78 
 
 		 354 aa  338  7e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  49.46 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  50.4 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  47.96 
 
 		 351 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  44.51 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  36.47 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0811  outer membrane porin, putative  35.43 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  33.33 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2092  porin  34.73 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  34.04 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  32.61 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  30.23 
 
 		 314 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  30.52 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  31.65 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  31.65 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  30.57 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  30.77 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  30.18 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  29.77 
 
 		 313 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  29.32 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  29.32 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  29.32 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  27.33 
 
 		 314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  28.81 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  29.75 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  28.3 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  27.33 
 
 		 316 aa  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  26.54 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  27.12 
 
 		 302 aa  96.3  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  29.15 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  28.07 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  30.17 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  26.17 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  25.75 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  25.53 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  24.74 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  27.18 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  25.64 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2038  porin  27.48 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  24.51 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  29.82 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  23.64 
 
 		 357 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3619  porin  24.6 
 
 		 319 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00814713  hitchhiker  0.000626755 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  24.71 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  30.73 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1463  porin  32.81 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000881778  normal  0.0418658 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  27.1 
 
 		 344 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2679  putative outer membrane protein (porin)  28.5 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  29.61 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  29.61 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  29.61 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  29.61 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  29.61 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  29.61 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  29.61 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  24.48 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  27.1 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  23.94 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  23.94 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  23.94 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  30.39 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  33.65 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  25.71 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  27.09 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  27.09 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  25.08 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  25.08 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1642  porin  26.15 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000869717  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  30.49 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02151  porin signal peptide protein  27.46 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  25 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  24.31 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  23.89 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  27.07 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>